202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3397 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 189 aa  371  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  87.15 
 
 		 177 aa  304  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  67.28 
 
 		 157 aa  207  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  69.38 
 
 		 153 aa  204  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  62.66 
 
 		 154 aa  184  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  67.95 
 
 		 152 aa  184  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  68.59 
 
 		 152 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  64.15 
 
 		 155 aa  181  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  63.46 
 
 		 151 aa  180  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  63.46 
 
 		 153 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  65.58 
 
 		 154 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  65.56 
 
 		 159 aa  170  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  60.54 
 
 		 162 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  60.54 
 
 		 162 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  60.54 
 
 		 162 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  65.75 
 
 		 158 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  64.19 
 
 		 155 aa  168  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 152 aa  167  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  62.87 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  64.19 
 
 		 161 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  60.13 
 
 		 157 aa  164  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  59.59 
 
 		 153 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  52.87 
 
 		 156 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  60.27 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  60 
 
 		 166 aa  159  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  61.01 
 
 		 153 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  50.96 
 
 		 152 aa  157  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  64.52 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  61.18 
 
 		 152 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  53.21 
 
 		 151 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  57.59 
 
 		 154 aa  155  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  53.16 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 157 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  49.38 
 
 		 154 aa  149  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  50.31 
 
 		 156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  62.34 
 
 		 151 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  57.05 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  61.15 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  52.2 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  49.38 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  48.43 
 
 		 154 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  51.57 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  51.57 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  54.9 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  45.57 
 
 		 151 aa  137  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  46.54 
 
 		 160 aa  135  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 156 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 156 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  46.84 
 
 		 160 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  46.84 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  43.21 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  47.56 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  51.63 
 
 		 155 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  47.47 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  48.45 
 
 		 152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  47.53 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  46.54 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  54.25 
 
 		 155 aa  127  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  45.91 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  46.91 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  46.45 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  45.57 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  45.57 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  44.51 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  44.51 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  46.54 
 
 		 155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  47.44 
 
 		 162 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  45.86 
 
 		 154 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  46.2 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  45.45 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  44.51 
 
 		 157 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  44.31 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  45.91 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  44.23 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3096  Endoribonuclease L-PSP  57.47 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000584514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  47.77 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  47.77 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  51.57 
 
 		 151 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  47.77 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  47.77 
 
 		 152 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  45.91 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  45.57 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  45.91 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  45.91 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  45.91 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  45.91 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  45.91 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  46.5 
 
 		 152 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  47.13 
 
 		 152 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 146 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  48.43 
 
 		 154 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  46.06 
 
 		 152 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  43.21 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  46.5 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  46.84 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>