221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3162 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3162  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.567156  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  83.23 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  81.88 
 
 		 152 aa  248  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  79.87 
 
 		 152 aa  244  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  79.19 
 
 		 152 aa  243  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  73.51 
 
 		 152 aa  234  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0402  endoribonuclease L-PSP  72.19 
 
 		 152 aa  225  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  75.33 
 
 		 152 aa  224  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  74 
 
 		 152 aa  223  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  74 
 
 		 152 aa  222  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  74 
 
 		 152 aa  222  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  74 
 
 		 152 aa  222  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  74 
 
 		 152 aa  222  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  73.33 
 
 		 152 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  72.48 
 
 		 154 aa  220  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2506  endoribonuclease L-PSP  81.63 
 
 		 151 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.101057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  72.67 
 
 		 164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  72.67 
 
 		 164 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  74.67 
 
 		 154 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  72.67 
 
 		 155 aa  217  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  72.67 
 
 		 152 aa  216  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  72.67 
 
 		 152 aa  216  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  72.67 
 
 		 152 aa  216  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  72.67 
 
 		 152 aa  216  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  72.67 
 
 		 152 aa  216  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  71.81 
 
 		 154 aa  215  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  71.52 
 
 		 152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  67.1 
 
 		 156 aa  206  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  73.15 
 
 		 154 aa  204  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3408  Endoribonuclease L-PSP  76.67 
 
 		 152 aa  203  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  72.26 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  72.26 
 
 		 156 aa  203  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  67.11 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2512  endoribonuclease L-PSP  65.77 
 
 		 150 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.796499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  69.18 
 
 		 151 aa  186  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  66.44 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  55.1 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  51.01 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  50.34 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  51.02 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 154 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  48.32 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  50.34 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  50.67 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  44.67 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  47.1 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  46.45 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  45.58 
 
 		 152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  44.9 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  46.5 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  46.81 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  42.18 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  48.32 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  51.37 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  48.63 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  47.95 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3462  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  47.33 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  45.21 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  45.7 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  45.21 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  42.67 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  46.79 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  48.67 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  46.62 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 177 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  43.05 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  40.69 
 
 		 163 aa  113  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>