200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5025 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 177 aa  358  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  44.08 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  43.42 
 
 		 158 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 162 aa  131  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  40.13 
 
 		 162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  38.67 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  40.14 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  36.69 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  40.82 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  36.69 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  38.03 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  28.66 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  40.15 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  37.42 
 
 		 407 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  35.17 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 151 aa  99.4  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  36.62 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  36.88 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 153 aa  97.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 156 aa  97.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  40.91 
 
 		 144 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  33.81 
 
 		 154 aa  97.1  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  33.8 
 
 		 162 aa  95.5  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 158 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 163 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 152 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  33.81 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  34.64 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 152 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  36.23 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  36.69 
 
 		 155 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  33.56 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  32.86 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  37.61 
 
 		 167 aa  88.2  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 155 aa  87.8  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  36.69 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  35.97 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  35.92 
 
 		 409 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  36.69 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  36.62 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  36.8 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  35.97 
 
 		 152 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  38.13 
 
 		 154 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0938  Endoribonuclease L-PSP  32.62 
 
 		 152 aa  85.5  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 155 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  33.8 
 
 		 153 aa  84.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 168 aa  84.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 163 aa  84.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 153 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  31.65 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  38.13 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  30.07 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0904  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 141 aa  84  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  35.61 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2204  Endoribonuclease L-PSP  39.86 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  33.09 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  31.33 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  31.33 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  32.61 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  29.86 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  34.59 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  30.14 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  30.52 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3891  putative endoribonuclease L-PSP  31.47 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  37.3 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  33.1 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  35.21 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  32.87 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  32.87 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  32.87 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>