210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0287 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0287  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2665  endoribonuclease L-PSP  59.87 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5806  endoribonuclease L-PSP  58.67 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2788  Endoribonuclease L-PSP  54.25 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4643  endoribonuclease L-PSP  46.75 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183681  normal  0.137047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7448  endoribonuclease L-PSP  46.98 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5670  endoribonuclease L-PSP  46.98 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6034  endoribonuclease L-PSP  46.98 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6524  endoribonuclease L-PSP  46.98 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5025  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1801  hypothetical protein  44.59 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0113627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  47.1 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  45.65 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  45.67 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3735  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0323381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2706  Endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  35.57 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5091  hypothetical protein  36.17 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 153 aa  97.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 168 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 162 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  36.81 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5760  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 165 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.332069  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  39.86 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6667  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0416868  normal  0.0241604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 189 aa  87.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  45.24 
 
 		 152 aa  87.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2908  Endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3891  putative endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  35.94 
 
 		 407 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1232  Endoribonuclease L-PSP  32.68 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0916  Endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0847  Endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00708228  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  31.5 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 154 aa  84.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  44.07 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  39.83 
 
 		 167 aa  84  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  42.06 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  38.13 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7001  Endoribonuclease L-PSP  31.88 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  36.69 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2988  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1705  Endoribonuclease L-PSP  35.97 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.182301  hitchhiker  0.0000000000000067862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1554  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0668  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  38.76 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  35.71 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  35.71 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  34.92 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  34.87 
 
 		 153 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  35.71 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  35.71 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>