276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1259 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1259  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
149 aa  291  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0123792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2951  Endoribonuclease L-PSP  55.88 
 
 
165 aa  134  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  55.78 
 
 
154 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  55.1 
 
 
154 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  55.1 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  50.97 
 
 
153 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  51.02 
 
 
153 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2784  endoribonuclease L-PSP  55.83 
 
 
155 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  48.98 
 
 
156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 
155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3006  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  47.55 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
155 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 
155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  47.3 
 
 
155 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  45.58 
 
 
158 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 
153 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 
155 aa  106  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 
151 aa  106  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  47.95 
 
 
157 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 
152 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 
152 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 
152 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 
152 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  46.94 
 
 
152 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  46.58 
 
 
154 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  47.95 
 
 
152 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 
156 aa  103  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 
152 aa  103  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 
154 aa  103  8e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  46.26 
 
 
152 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
154 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  44.87 
 
 
177 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  44.97 
 
 
157 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  44.44 
 
 
155 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 
162 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 
162 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 
152 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  45.58 
 
 
155 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  45.58 
 
 
152 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  45.58 
 
 
164 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  45.58 
 
 
152 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  45.58 
 
 
152 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  45.58 
 
 
152 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  45.58 
 
 
152 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  42.76 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0250  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 
155 aa  98.6  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  44.22 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  44.3 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  46.81 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  46.81 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  45.27 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4704  hypothetical protein  51.61 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0986  hypothetical protein  44.9 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0698758  normal  0.152684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  46.21 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 
155 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0894  hypothetical protein  48.63 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53740  hypothetical protein  51.61 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00018421  hitchhiker  0.00710422 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2553  endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5081  endoribonuclease L-PSP  43.54 
 
 
152 aa  94.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 
189 aa  94.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  43.15 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 
157 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 
157 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  35.62 
 
 
156 aa  93.6  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2111  endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 
141 aa  93.6  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3333  hypothetical protein  46.56 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.440014  normal  0.330579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  44.06 
 
 
407 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  42.18 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  45.21 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  46.1 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5181  endoribonuclease L-PSP  45.71 
 
 
154 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37922  predicted protein  46.27 
 
 
185 aa  92.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00476754  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47655  predicted protein  46.27 
 
 
185 aa  92.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00618585  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  41.78 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0228  Endoribonuclease L-PSP  44.85 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2111  Endoribonuclease L-PSP  40.56 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2348  endoribonuclease L-PSP  42.47 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  42.95 
 
 
157 aa  90.9  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>