189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5003 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 517 aa  1064    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  47.89 
 
 		 572 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.98 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.37 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.57 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  46.32 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  42.86 
 
 		 518 aa  359  8e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  39.95 
 
 		 714 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.97 
 
 		 521 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  40.05 
 
 		 502 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  41.83 
 
 		 714 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.65 
 
 		 502 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  36.94 
 
 		 491 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.66 
 
 		 701 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  38.05 
 
 		 735 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  37.02 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  37.44 
 
 		 483 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  34.85 
 
 		 525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.33 
 
 		 498 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  36.5 
 
 		 714 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  36.88 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.71 
 
 		 504 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  35.47 
 
 		 724 aa  276  8e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  34.47 
 
 		 512 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  35.24 
 
 		 717 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  37.14 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  37.94 
 
 		 739 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  35.07 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  38.07 
 
 		 732 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  38.07 
 
 		 732 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  36.76 
 
 		 735 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  37.71 
 
 		 739 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  37.39 
 
 		 732 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  38.07 
 
 		 746 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  34.24 
 
 		 730 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  33.12 
 
 		 510 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.17 
 
 		 713 aa  241  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  35.11 
 
 		 482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  36.66 
 
 		 728 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  36.66 
 
 		 728 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  34.57 
 
 		 803 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  39.13 
 
 		 515 aa  229  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.43 
 
 		 517 aa  227  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.55 
 
 		 513 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  32.29 
 
 		 720 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.66 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.43 
 
 		 507 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  29.47 
 
 		 738 aa  192  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  29.49 
 
 		 470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.18 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  28.96 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  31.91 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  28.33 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  32.09 
 
 		 754 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  32.09 
 
 		 754 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  31.78 
 
 		 734 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  22.01 
 
 		 1522 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  28.03 
 
 		 516 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  28.03 
 
 		 516 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  30.48 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  23.2 
 
 		 1783 aa  84  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  27.97 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  25.49 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  22.89 
 
 		 1821 aa  77.8  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  22.93 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.33 
 
 		 632 aa  73.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  22.59 
 
 		 801 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  25.1 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.29 
 
 		 544 aa  67.4  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.87 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.14 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  24.17 
 
 		 833 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  25.14 
 
 		 537 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  22.66 
 
 		 676 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  22.54 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.86 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  21 
 
 		 514 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  20.78 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  41.25 
 
 		 684 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  20.73 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  22.28 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.46 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  20.73 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  20.73 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  20.73 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  20.73 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  20.73 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  23.98 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  20.73 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  20.11 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  20.73 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.84 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  26.99 
 
 		 474 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  36.84 
 
 		 655 aa  57  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  28.08 
 
 		 775 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.51 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  28.87 
 
 		 780 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  22.44 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  22.31 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  20.45 
 
 		 759 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>