64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5009 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5009  exoD protein  100 
 
 		 212 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  43.78 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5360  hypothetical protein  49.7 
 
 		 317 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  hitchhiker  0.00309893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  35.03 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4382  Exopolysaccharide synthesis ExoD  30.39 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0680521 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  29.23 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  29.29 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  31.18 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  31.18 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2415  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.82 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2365  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.82 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1827  exopolysaccharide synthesis, ExoD  31.96 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3870  uncharacterized ABC-type transport system permease protein  31.87 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2869  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.98 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0151  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  25.48 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.19 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.22 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  29.14 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2622  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.97 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512151  normal  0.293711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3452  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.87 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  24.74 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3754  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.52 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.11 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2195  exopolysaccharide synthesis ExoD  28.42 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1302  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.9 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0307  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.59 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2945  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.64 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0152237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0769  exopolysaccharide synthesis protein  24.64 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0140556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1440  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.24 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.97 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2731  exopolysaccharide synthesis, ExoD  40 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  27.54 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0209  exopolysaccharide synthesis protein  29.55 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.742112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  34.65 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.65 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  27.32 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.03 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1022  exopolysaccharide synthesis, ExoD  28.09 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0915242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1715  uncharacterized ABC-type transport system permease component-like protein  34.32 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4949  Exopolysaccharide synthesis ExoD  25.81 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.811076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.28 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.71 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0979  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.54 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1193  Exopolysaccharide synthesis ExoD  32.92 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1687  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.72 
 
 		 313 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.882846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.68 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1063  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.92 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.0691712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1212  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.45 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1242  Exopolysaccharide synthesis ExoD  27.45 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.345513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  26.51 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  33.52 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  30.49 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6438  exopolysaccharide synthesis ExoD  31.48 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  32.81 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.42 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4288  exopolysaccharide synthesis protein, putative  27.75 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  32.42 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.18 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.72 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  24.76 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  25.64 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2866  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.73 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0682  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.34 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  26.13 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>