More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5053 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  66.8 
 
 		 481 aa  650    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  100 
 
 		 482 aa  973    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  73.7 
 
 		 481 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  73.28 
 
 		 481 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  60.13 
 
 		 498 aa  591  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  60.71 
 
 		 482 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  62.11 
 
 		 482 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  62.53 
 
 		 483 aa  578  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  63.35 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  63.41 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  60.25 
 
 		 483 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  61.9 
 
 		 482 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  61.9 
 
 		 483 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  61.28 
 
 		 483 aa  570  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  59.63 
 
 		 483 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  60.66 
 
 		 483 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  59.08 
 
 		 488 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  62.32 
 
 		 483 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  59.75 
 
 		 480 aa  557  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  62.11 
 
 		 483 aa  552  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  63.2 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  62.11 
 
 		 483 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  62.53 
 
 		 483 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  62.11 
 
 		 483 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  62.73 
 
 		 483 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  61.49 
 
 		 483 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  61.36 
 
 		 484 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  58.84 
 
 		 466 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  62.32 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  53.22 
 
 		 483 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  60.87 
 
 		 482 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  60.66 
 
 		 482 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  54.09 
 
 		 483 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  62.73 
 
 		 483 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  57.88 
 
 		 482 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  62.11 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  58.51 
 
 		 482 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 		 483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 		 483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  57.26 
 
 		 482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 		 483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 		 483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  62.32 
 
 		 483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  57.68 
 
 		 482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  57.68 
 
 		 482 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  62.32 
 
 		 483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 		 483 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  60.66 
 
 		 482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  59.42 
 
 		 483 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  60.37 
 
 		 494 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  56.85 
 
 		 482 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  52.79 
 
 		 483 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  53.49 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  56.13 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  55.84 
 
 		 481 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  60.46 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  51.15 
 
 		 508 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 484 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  58.71 
 
 		 482 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  58.71 
 
 		 521 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  58.71 
 
 		 482 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  58.71 
 
 		 521 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  58.71 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  48.85 
 
 		 489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  41.04 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 		 480 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  44.69 
 
 		 482 aa  359  5e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  46.56 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  41.32 
 
 		 484 aa  348  9e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  38.27 
 
 		 486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 		 489 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 		 510 aa  318  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  38.25 
 
 		 489 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  39.96 
 
 		 503 aa  318  2e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.72 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  37.74 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.28 
 
 		 503 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  39.03 
 
 		 510 aa  312  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  35.32 
 
 		 486 aa  312  9e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  39.04 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.87 
 
 		 503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.26 
 
 		 489 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.26 
 
 		 489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  45.11 
 
 		 487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  39.22 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 489 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.84 
 
 		 489 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.89 
 
 		 480 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 490 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  38.58 
 
 		 482 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  41.43 
 
 		 489 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.98 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.58 
 
 		 491 aa  300  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>