More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5022 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  100 
 
 		 478 aa  975    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  64.38 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  68.9 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  61.26 
 
 		 474 aa  551  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  65.45 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  58.67 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  63.6 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  54.98 
 
 		 484 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  55.17 
 
 		 490 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  54.89 
 
 		 485 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  48.23 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  45.7 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  47.7 
 
 		 475 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  50 
 
 		 482 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  49.89 
 
 		 481 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  47.17 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  46.74 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  46.74 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.74 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.74 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.96 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  47.19 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.52 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  48.94 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  46.14 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  45.61 
 
 		 483 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  40.34 
 
 		 509 aa  332  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  40.35 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  40.63 
 
 		 481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  39.23 
 
 		 474 aa  315  9e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  40.43 
 
 		 492 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  39.25 
 
 		 493 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  40.69 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  37.78 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  38.7 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  39.01 
 
 		 493 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  36.32 
 
 		 568 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  31.13 
 
 		 400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  30.09 
 
 		 401 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  30.13 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  30.23 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.72 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  31.28 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  31.28 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  31.06 
 
 		 401 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  29.71 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  30.16 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  30.16 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  31.28 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.84 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  30.62 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  32.58 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  33.25 
 
 		 447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  27.15 
 
 		 392 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  32.38 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  30.61 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  30.02 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  27.94 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  36.49 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.56 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  29.08 
 
 		 402 aa  150  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  29.08 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  29.23 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  27.21 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  30.85 
 
 		 399 aa  143  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  30.09 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  31.36 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  27.67 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  27.67 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  34.18 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  31.15 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  31.78 
 
 		 384 aa  137  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  32.15 
 
 		 419 aa  136  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  32.88 
 
 		 393 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  28.21 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  34.86 
 
 		 423 aa  134  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.84 
 
 		 447 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  31.17 
 
 		 397 aa  133  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  32.61 
 
 		 395 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  28.98 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  32.07 
 
 		 481 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  31.57 
 
 		 414 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  27.79 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  25.81 
 
 		 396 aa  126  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.96 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  33.1 
 
 		 408 aa  114  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  27.49 
 
 		 527 aa  113  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  31.38 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  27.4 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  27.81 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  23.22 
 
 		 527 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  26.67 
 
 		 389 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  26.3 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  28.17 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2037  Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase-like protein  22.03 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4200  amidohydrolase  27.31 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0397  amidohydrolase  29.8 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  28.57 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>