More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4291 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  100 
 
 		 386 aa  782    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  72.7 
 
 		 387 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  66.32 
 
 		 387 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  42.17 
 
 		 401 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  43.95 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  43.44 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  46.37 
 
 		 395 aa  293  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  42.17 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  42.05 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  41.92 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  41.92 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  41.92 
 
 		 401 aa  288  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  41.67 
 
 		 401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  41.67 
 
 		 401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.37 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  40 
 
 		 418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  40.26 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  38.85 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  38.06 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  37.53 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  38.85 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  38.72 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  38.72 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  39.33 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  36.71 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  38.54 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  41.95 
 
 		 393 aa  245  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  41.14 
 
 		 447 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  37.21 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  38.68 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  36.36 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  36.1 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  36.1 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  37.7 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  36.25 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  37.29 
 
 		 402 aa  225  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  36.31 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  37.37 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  39.39 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  36.71 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  41.6 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  40.56 
 
 		 415 aa  213  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  38.82 
 
 		 441 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  33.64 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  32.62 
 
 		 481 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  31.99 
 
 		 509 aa  202  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  32.2 
 
 		 425 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  35.83 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  42.91 
 
 		 274 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  38.01 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  34.25 
 
 		 493 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  32.83 
 
 		 419 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  38.11 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  37.39 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  39.17 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  37.42 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  34.43 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  34.56 
 
 		 483 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  29.17 
 
 		 483 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  37.04 
 
 		 490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  29.12 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  30.96 
 
 		 484 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  28.87 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  31.59 
 
 		 472 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  29.89 
 
 		 474 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  33 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  33.95 
 
 		 493 aa  166  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  29.56 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  31.35 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  35.44 
 
 		 481 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  35.44 
 
 		 481 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  35.44 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  35.44 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  35.44 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  35.44 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  29.2 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  35.44 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  31.86 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  36.79 
 
 		 482 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  35.44 
 
 		 481 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  35.44 
 
 		 481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  30.02 
 
 		 439 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  29.86 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  36.1 
 
 		 481 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  31.33 
 
 		 490 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  32.66 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  30.62 
 
 		 483 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  30.35 
 
 		 473 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  29.48 
 
 		 472 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  29.24 
 
 		 483 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  29.53 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  29.8 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  27.05 
 
 		 568 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  31.08 
 
 		 471 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0327  amidohydrolase amhX  31.3 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0867486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0311  amidohydrolase  31.03 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0342  amidohydrolase amhX  31.3 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0374  amidohydrolase amhX  31.03 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2974  aminoacylase (N-acyl-L-amino-acid amidohydrolase), N-terminal  42.98 
 
 		 119 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0314  amidohydrolase  31.03 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0170762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>