More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2651 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  100 
 
 
493 aa  995    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  67.32 
 
 
493 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  60.82 
 
 
481 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  59.13 
 
 
492 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  56.39 
 
 
509 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  51.58 
 
 
490 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  41.81 
 
 
473 aa  348  2e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  45.91 
 
 
483 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  41.93 
 
 
475 aa  319  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  41.03 
 
 
472 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  42.83 
 
 
482 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  41.06 
 
 
472 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  41.33 
 
 
481 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  39.64 
 
 
481 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  38.18 
 
 
483 aa  309  9e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  39.51 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  39.51 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.51 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  40.93 
 
 
451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.51 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.51 
 
 
481 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.51 
 
 
481 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  39.55 
 
 
454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.51 
 
 
481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  39.11 
 
 
474 aa  306  7e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  40.05 
 
 
484 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  42.02 
 
 
474 aa  293  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  42.57 
 
 
473 aa  290  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  40.9 
 
 
490 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  39.82 
 
 
485 aa  274  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  38.63 
 
 
472 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  39.56 
 
 
483 aa  269  7e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  40.44 
 
 
473 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  38.15 
 
 
483 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  38.73 
 
 
471 aa  253  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  38.8 
 
 
478 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  37.26 
 
 
568 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  36.12 
 
 
389 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  39.47 
 
 
471 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  34.68 
 
 
401 aa  220  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  35.37 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.15 
 
 
401 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  34.83 
 
 
401 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  34.92 
 
 
401 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  34.61 
 
 
401 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.38 
 
 
401 aa  206  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  34.61 
 
 
401 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  34.61 
 
 
401 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.86 
 
 
401 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  32.79 
 
 
388 aa  203  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  29.82 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  32.41 
 
 
393 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  31.19 
 
 
397 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  34.1 
 
 
387 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  34.61 
 
 
447 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  34.6 
 
 
393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  34.25 
 
 
386 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.28 
 
 
447 aa  177  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  31.89 
 
 
409 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  31.12 
 
 
397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  30.11 
 
 
394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  34.14 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  28.77 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  30.5 
 
 
394 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  30.5 
 
 
394 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  26.14 
 
 
396 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  29.71 
 
 
419 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  34.2 
 
 
414 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  31.42 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  28.51 
 
 
527 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  31.72 
 
 
395 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  30.63 
 
 
398 aa  150  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  33.76 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  34.21 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  29.11 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  31.88 
 
 
393 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  30.12 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  34.45 
 
 
399 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  33.22 
 
 
390 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  28.57 
 
 
393 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  32.77 
 
 
391 aa  140  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  27.84 
 
 
425 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  28.07 
 
 
393 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  28.07 
 
 
393 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  28.32 
 
 
394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.99 
 
 
274 aa  133  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  29.86 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  34.45 
 
 
423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  26.32 
 
 
527 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 
449 aa  120  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  34.11 
 
 
408 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  30.77 
 
 
415 aa  114  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  28.46 
 
 
403 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  28.53 
 
 
389 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  25.82 
 
 
439 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  29.49 
 
 
447 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  31.31 
 
 
428 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0516  amidohydrolase  24.42 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2632  amidohydrolase  31.43 
 
 
367 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0397  amidohydrolase  24.86 
 
 
443 aa  94  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>