More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6644 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  83.99 
 
 
481 aa  820    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  100 
 
 
482 aa  992    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  49.58 
 
 
483 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  54.08 
 
 
472 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  49.79 
 
 
484 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  51.05 
 
 
475 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  51.17 
 
 
481 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  51.17 
 
 
481 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  50.74 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  50.74 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  50.74 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  50.96 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  50.74 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  51.37 
 
 
472 aa  448  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  50.74 
 
 
481 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  50.84 
 
 
483 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  49.68 
 
 
485 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  52.04 
 
 
454 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  50.87 
 
 
490 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  49.68 
 
 
474 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  51.95 
 
 
483 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  51.9 
 
 
472 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  49.25 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  51.46 
 
 
471 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  50 
 
 
478 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  52.24 
 
 
473 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  51.03 
 
 
471 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  44.4 
 
 
509 aa  358  9e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  42.49 
 
 
473 aa  349  7e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  42.73 
 
 
481 aa  330  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  41.31 
 
 
474 aa  331  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  39.58 
 
 
490 aa  326  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  42.83 
 
 
493 aa  319  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  41.4 
 
 
492 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  40.22 
 
 
483 aa  301  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  38.25 
 
 
451 aa  291  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  42.21 
 
 
493 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  34.2 
 
 
568 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  31.88 
 
 
401 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  31.88 
 
 
401 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.1 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  31.58 
 
 
400 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  31.88 
 
 
401 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.59 
 
 
401 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  31.59 
 
 
401 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  31.44 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  37.42 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  30.7 
 
 
389 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  30.8 
 
 
393 aa  168  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  31.64 
 
 
394 aa  164  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.62 
 
 
401 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  37.54 
 
 
447 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  30.16 
 
 
394 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  30.16 
 
 
394 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  29.56 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  27.27 
 
 
425 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  38.52 
 
 
399 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  31.14 
 
 
409 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  30.77 
 
 
387 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  35.49 
 
 
391 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  27.99 
 
 
392 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  28.92 
 
 
386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  33.54 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  36.18 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  32.75 
 
 
414 aa  146  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  34.21 
 
 
394 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  29.72 
 
 
402 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  28.64 
 
 
393 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  33.33 
 
 
397 aa  143  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  29.82 
 
 
393 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  30.61 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  28.7 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  28.7 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  33.76 
 
 
397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  32.93 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  36.04 
 
 
423 aa  140  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  35.14 
 
 
390 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  28.57 
 
 
402 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  35.56 
 
 
441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  25.49 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  28.6 
 
 
393 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  33.55 
 
 
481 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  36.62 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  30.88 
 
 
384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  29.58 
 
 
395 aa  126  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  30.03 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  26.42 
 
 
527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  27.22 
 
 
449 aa  111  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.5 
 
 
274 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  30.23 
 
 
398 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  28.16 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  25.79 
 
 
527 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  26.98 
 
 
389 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  31.29 
 
 
415 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  26.86 
 
 
389 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  30.58 
 
 
389 aa  87  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3456  amidohydrolase  29.63 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960361  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  25.6 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  28.29 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  30.32 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>