More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1350 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  100 
 
 
473 aa  955    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  46.7 
 
 
474 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  48.22 
 
 
509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  44.66 
 
 
483 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  43.97 
 
 
481 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  43.59 
 
 
492 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  43.61 
 
 
490 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  46.15 
 
 
483 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  45.06 
 
 
472 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  42.34 
 
 
484 aa  363  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  43.41 
 
 
475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.42 
 
 
481 aa  359  7e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  41.2 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  41.2 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.2 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.2 
 
 
481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  41.33 
 
 
481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.2 
 
 
481 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  41.81 
 
 
493 aa  356  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.42 
 
 
481 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  43.44 
 
 
481 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  42.41 
 
 
483 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  43.52 
 
 
472 aa  346  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  41.99 
 
 
454 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  42.83 
 
 
483 aa  342  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  43.88 
 
 
451 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  42.03 
 
 
473 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  42.49 
 
 
482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  41.68 
 
 
490 aa  340  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  42.33 
 
 
485 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  43.14 
 
 
493 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  41.34 
 
 
472 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  39.78 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  43.07 
 
 
471 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  40.38 
 
 
568 aa  290  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  44.37 
 
 
471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  41.94 
 
 
473 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  40.35 
 
 
478 aa  280  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  34.68 
 
 
400 aa  229  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  34 
 
 
401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  32.53 
 
 
393 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.45 
 
 
401 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  34.23 
 
 
401 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.23 
 
 
401 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  34.23 
 
 
401 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  33.78 
 
 
401 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  34.23 
 
 
401 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  33.56 
 
 
401 aa  209  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  32.19 
 
 
389 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  37.54 
 
 
388 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  31.57 
 
 
394 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  31.57 
 
 
394 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.7 
 
 
401 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  32 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  33.26 
 
 
387 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  35.53 
 
 
387 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  28.32 
 
 
392 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  37.42 
 
 
386 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.96 
 
 
447 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  35.67 
 
 
397 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  36.91 
 
 
393 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  33.44 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  28.03 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  38.51 
 
 
395 aa  173  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  39.93 
 
 
447 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  33.44 
 
 
402 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  35.37 
 
 
409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  28.51 
 
 
527 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  33.13 
 
 
402 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  33.73 
 
 
391 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  29.07 
 
 
398 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  34.74 
 
 
393 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  33.07 
 
 
399 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  33.44 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  33.44 
 
 
393 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  33.44 
 
 
393 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  33.26 
 
 
414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  34.9 
 
 
481 aa  146  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  28.83 
 
 
527 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  36.3 
 
 
390 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  33.88 
 
 
392 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  33.85 
 
 
384 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  35.32 
 
 
394 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  30.75 
 
 
419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.54 
 
 
274 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  26.69 
 
 
396 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  30.49 
 
 
441 aa  134  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  33.67 
 
 
423 aa  133  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  33.89 
 
 
408 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  27.44 
 
 
425 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  31.19 
 
 
403 aa  113  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  26.97 
 
 
439 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  31.46 
 
 
415 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  25.24 
 
 
389 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  24.92 
 
 
389 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4200  amidohydrolase  29.32 
 
 
438 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  31.85 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0516  amidohydrolase  30.38 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0397  amidohydrolase  29.11 
 
 
443 aa  92.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>