More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2614 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  100 
 
 		 418 aa  845    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  45.71 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  47.85 
 
 		 447 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  43.92 
 
 		 391 aa  289  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  46.81 
 
 		 399 aa  289  8e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  45.55 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  42.34 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  42.06 
 
 		 402 aa  279  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  38.17 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  38.97 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  37.31 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  41.73 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  40.64 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  40.64 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  40.64 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  38.42 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.42 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.68 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  40.97 
 
 		 447 aa  266  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  38.17 
 
 		 401 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  40.36 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  39.84 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  37.91 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  37.91 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  37.91 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  40 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  39.63 
 
 		 392 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  40.99 
 
 		 387 aa  259  9e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  38.1 
 
 		 419 aa  255  9e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.66 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  42.46 
 
 		 390 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  37.17 
 
 		 394 aa  249  9e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  41.24 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  36.01 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  36.01 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  39.01 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  40.79 
 
 		 481 aa  243  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  39.43 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  39.28 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  37.33 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  37.6 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  34.25 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  42.16 
 
 		 415 aa  230  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  34.87 
 
 		 392 aa  229  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  36.07 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  33.41 
 
 		 425 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  37.7 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  39.24 
 
 		 423 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  38.83 
 
 		 403 aa  189  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  33.16 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  39.24 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  31.45 
 
 		 484 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  29.56 
 
 		 509 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  32.51 
 
 		 473 aa  179  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  30.02 
 
 		 483 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.43 
 
 		 274 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  30.98 
 
 		 492 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  30.34 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  29.58 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  30.65 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  30.3 
 
 		 474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  29.08 
 
 		 490 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  28.77 
 
 		 493 aa  173  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  31 
 
 		 485 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  31.73 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  29.85 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  28.34 
 
 		 481 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  28.03 
 
 		 473 aa  168  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  27.56 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  27.31 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  27.31 
 
 		 481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  27.31 
 
 		 481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  27.31 
 
 		 481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  27.53 
 
 		 481 aa  163  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  27.31 
 
 		 481 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  27.53 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  27.97 
 
 		 481 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  29.05 
 
 		 483 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  26.79 
 
 		 483 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  29.44 
 
 		 483 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  33.33 
 
 		 481 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  30 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  27.58 
 
 		 472 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  28.83 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  32.79 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  25.63 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  30.22 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  25.63 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  29.57 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  29.82 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  30.39 
 
 		 478 aa  133  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  28.86 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  30.95 
 
 		 568 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  26.23 
 
 		 527 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  26.39 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  26.39 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  28.87 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  26.62 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  26.77 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>