More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1049 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  100 
 
 		 493 aa  994    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  66.39 
 
 		 493 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  55.49 
 
 		 492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  55.25 
 
 		 509 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  53.1 
 
 		 481 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  48.38 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  43.14 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  42.37 
 
 		 483 aa  319  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  38.98 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  39.7 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  41.74 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.74 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  41.74 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  41.88 
 
 		 481 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.51 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  39.69 
 
 		 474 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.51 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.51 
 
 		 481 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  43.05 
 
 		 481 aa  300  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  41.51 
 
 		 481 aa  299  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  42.21 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  41.92 
 
 		 454 aa  296  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  38.98 
 
 		 451 aa  296  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  40.9 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  39.75 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  40.09 
 
 		 475 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  39.7 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  39.95 
 
 		 472 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  39.43 
 
 		 485 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  39.52 
 
 		 490 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  40.93 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  38.96 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  41.16 
 
 		 483 aa  257  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  39.22 
 
 		 473 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  37.69 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  33.99 
 
 		 568 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  40.58 
 
 		 471 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  38.58 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  36.12 
 
 		 401 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.6 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  35.38 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.36 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  36.12 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  36.36 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  36.12 
 
 		 401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  35.89 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  35.89 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.89 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  33.74 
 
 		 389 aa  200  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  30.16 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  28.81 
 
 		 392 aa  180  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  32.85 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  33.95 
 
 		 386 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  34.84 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  35.9 
 
 		 414 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  33.57 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  31.19 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.56 
 
 		 447 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  35.78 
 
 		 393 aa  170  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  31.18 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  33.17 
 
 		 387 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  32.92 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  30.48 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  30.2 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  30.2 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  33.02 
 
 		 395 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  30.22 
 
 		 418 aa  156  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  37.92 
 
 		 393 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  31.61 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  32.01 
 
 		 441 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  36.26 
 
 		 391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  33.95 
 
 		 399 aa  146  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  30.5 
 
 		 393 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  36.06 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  36.9 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  28.48 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  34.98 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  30.25 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  30.25 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  30.75 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  30.16 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  35.6 
 
 		 394 aa  140  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  25.79 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.09 
 
 		 274 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  31.12 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  34.29 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  31.55 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  26.59 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  26.13 
 
 		 527 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  30.53 
 
 		 403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  32.82 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  24.52 
 
 		 527 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  27.19 
 
 		 389 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  26.19 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  30.72 
 
 		 396 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  30.72 
 
 		 396 aa  90.1  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  30.9 
 
 		 396 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  28.75 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  30.9 
 
 		 396 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>