More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0260 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  100 
 
 
389 aa  792    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  43.16 
 
 
401 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  43.31 
 
 
400 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  43.68 
 
 
401 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  43.68 
 
 
401 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  43.68 
 
 
401 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  43.42 
 
 
401 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  43.16 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  43.16 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  43.04 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  43.16 
 
 
401 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  40.48 
 
 
388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  40.21 
 
 
387 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  38.85 
 
 
386 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  38.81 
 
 
394 aa  246  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  38.81 
 
 
394 aa  246  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  38.16 
 
 
393 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  36.5 
 
 
396 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  37.95 
 
 
393 aa  237  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  37.33 
 
 
418 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  37.53 
 
 
394 aa  234  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  36.12 
 
 
493 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  37.36 
 
 
447 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  36.51 
 
 
397 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  39.16 
 
 
395 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  38.4 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  37.33 
 
 
397 aa  226  7e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  37.31 
 
 
419 aa  225  9e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  37.79 
 
 
391 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  33.56 
 
 
492 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  35.04 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  34.38 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  38.9 
 
 
399 aa  216  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  35.83 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  33.97 
 
 
483 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  33.61 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  33.61 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  33.61 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  36.01 
 
 
409 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  37.11 
 
 
402 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  37.53 
 
 
414 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  33.69 
 
 
394 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  32.2 
 
 
481 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  35.94 
 
 
441 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  32.19 
 
 
473 aa  202  6e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  34.75 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  35.51 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  34.25 
 
 
390 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  36.83 
 
 
392 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  31.2 
 
 
425 aa  192  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  35.36 
 
 
398 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  29.13 
 
 
483 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  34 
 
 
449 aa  190  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  29.69 
 
 
490 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  32.35 
 
 
484 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  33.74 
 
 
493 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  29.1 
 
 
451 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.54 
 
 
274 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  32.85 
 
 
384 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  36.77 
 
 
415 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  30.77 
 
 
472 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  29.44 
 
 
475 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  30.92 
 
 
481 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  37.5 
 
 
482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  29.55 
 
 
474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  31.21 
 
 
473 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  28.67 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  31.26 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  35.07 
 
 
403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  29.36 
 
 
481 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  28.38 
 
 
481 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  30.63 
 
 
485 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  29.82 
 
 
481 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  29.13 
 
 
481 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  28.15 
 
 
481 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  29.13 
 
 
481 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  29.13 
 
 
481 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  29.13 
 
 
481 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  29.02 
 
 
472 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  31.06 
 
 
481 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  29.07 
 
 
454 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  27.66 
 
 
490 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  30.89 
 
 
471 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  28.2 
 
 
483 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  35.11 
 
 
483 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  28.94 
 
 
473 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  33.23 
 
 
478 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  35.44 
 
 
423 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  26.36 
 
 
389 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  25.84 
 
 
389 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  35.54 
 
 
408 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  29.91 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  29.69 
 
 
568 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  30.45 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  27.38 
 
 
439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  29.03 
 
 
396 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  26.21 
 
 
527 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  28.57 
 
 
396 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  29.01 
 
 
395 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2974  aminoacylase (N-acyl-L-amino-acid amidohydrolase), N-terminal  48.98 
 
 
119 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>