More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1741 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  100 
 
 
395 aa  787    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  92.64 
 
 
396 aa  738    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  69.29 
 
 
396 aa  552  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  39.34 
 
 
390 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  40.68 
 
 
390 aa  296  6e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.58 
 
 
391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  41.24 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  41.18 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  43.52 
 
 
394 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  42.49 
 
 
388 aa  282  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  43.15 
 
 
394 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.93 
 
 
390 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  41.54 
 
 
395 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  42.67 
 
 
412 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  39.55 
 
 
400 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  41.62 
 
 
393 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  40.86 
 
 
392 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  43 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  40.69 
 
 
396 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  40.69 
 
 
396 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  40.25 
 
 
398 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  40.25 
 
 
398 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  40.91 
 
 
380 aa  271  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  41.33 
 
 
399 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  44.69 
 
 
393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  39.85 
 
 
391 aa  269  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.27 
 
 
391 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  38.36 
 
 
391 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  40.26 
 
 
394 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.27 
 
 
391 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.46 
 
 
405 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.79 
 
 
391 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  41.94 
 
 
400 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  42.16 
 
 
388 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  45.34 
 
 
384 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  40 
 
 
394 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  39.01 
 
 
391 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  40.72 
 
 
389 aa  265  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  39.49 
 
 
381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  38.54 
 
 
449 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  38.74 
 
 
391 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  38.62 
 
 
387 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.01 
 
 
391 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  38.24 
 
 
398 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  40.25 
 
 
381 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  44.76 
 
 
395 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  38.82 
 
 
403 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  39.27 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  42.26 
 
 
395 aa  263  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  38.24 
 
 
398 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.73 
 
 
381 aa  262  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  43.18 
 
 
400 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  38.82 
 
 
403 aa  262  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  44.76 
 
 
396 aa  262  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  40.1 
 
 
381 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  41.13 
 
 
393 aa  262  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  43.04 
 
 
386 aa  262  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  43.38 
 
 
398 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  40.7 
 
 
387 aa  259  6e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  39.13 
 
 
381 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  37.31 
 
 
391 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  38.87 
 
 
381 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.53 
 
 
400 aa  257  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  39.49 
 
 
392 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  43.01 
 
 
395 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.27 
 
 
391 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.22 
 
 
391 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  40.72 
 
 
390 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  40.2 
 
 
396 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  40.15 
 
 
397 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  43.85 
 
 
396 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.24 
 
 
396 aa  256  6e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  38.26 
 
 
393 aa  256  7e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  40.05 
 
 
402 aa  256  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.27 
 
 
405 aa  255  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  40.41 
 
 
392 aa  255  9e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  37.4 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  40.78 
 
 
393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  39.95 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  39.8 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  40.98 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  42.86 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  41.79 
 
 
391 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.7 
 
 
391 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  41.16 
 
 
388 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  38.96 
 
 
408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  40.98 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.27 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.32 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  37.66 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  40.91 
 
 
401 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  40 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  37.43 
 
 
391 aa  253  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  37.43 
 
 
391 aa  253  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  41.79 
 
 
391 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  44.36 
 
 
396 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  44.36 
 
 
399 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  44.36 
 
 
399 aa  252  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  38.19 
 
 
405 aa  252  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  39.24 
 
 
396 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>