More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0719 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  100 
 
 		 473 aa  958    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  61.52 
 
 		 474 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  60.04 
 
 		 490 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  63.18 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  54.64 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  58.21 
 
 		 472 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  61.7 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  55.29 
 
 		 485 aa  499  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  61.83 
 
 		 471 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  58.67 
 
 		 478 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  52.26 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.28 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  45.45 
 
 		 483 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  45.86 
 
 		 481 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  45.65 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  45.86 
 
 		 481 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  45.86 
 
 		 481 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  45.86 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  46.2 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  49.13 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  49.25 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  45.61 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  48.18 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  46.17 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  49.25 
 
 		 482 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  46.27 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  46.01 
 
 		 483 aa  362  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  42.03 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  40.26 
 
 		 509 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  40.13 
 
 		 481 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  41.67 
 
 		 492 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  42.51 
 
 		 483 aa  310  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  42.57 
 
 		 493 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  39.96 
 
 		 474 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  39.07 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  40.62 
 
 		 451 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  39.75 
 
 		 493 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  34.35 
 
 		 568 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  32.51 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  30.7 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  32.45 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  32.45 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  32.23 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  29.45 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  30.11 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  33.58 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  29.1 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.33 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  31.75 
 
 		 393 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  29.45 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.74 
 
 		 401 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  29.23 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  29.23 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.45 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  33.1 
 
 		 409 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  29.66 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  29.23 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  28.94 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  34.23 
 
 		 399 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  29.01 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  32.9 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  31.86 
 
 		 386 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  36.34 
 
 		 392 aa  156  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  30.02 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  32.74 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  38.91 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  27.45 
 
 		 394 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  27.45 
 
 		 394 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  31.9 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  27.01 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  31.17 
 
 		 391 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  32.37 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  27.75 
 
 		 425 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  37.59 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  28.27 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  29.52 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  28.85 
 
 		 397 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  38.71 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  31.55 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  29.3 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  28.96 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  26.68 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  35.16 
 
 		 390 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  29.61 
 
 		 481 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  27.77 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  29.66 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  29.27 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  26.51 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  27.72 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  30.79 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  36.13 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  31.67 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  27.5 
 
 		 274 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  26.92 
 
 		 389 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  32.64 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  31.78 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  27.83 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2632  amidohydrolase  30.74 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  24.85 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  26.27 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>