More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0345 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  100 
 
 		 483 aa  983    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  50.82 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  47 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  46.68 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  46.73 
 
 		 492 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  43.47 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  43.64 
 
 		 474 aa  363  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  44.9 
 
 		 493 aa  353  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  42.11 
 
 		 484 aa  341  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  42.46 
 
 		 475 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  42.24 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  41.85 
 
 		 472 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  39.36 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  42.64 
 
 		 473 aa  323  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  42.33 
 
 		 472 aa  319  6e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  42.95 
 
 		 493 aa  316  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  40.21 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  41.47 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  38.24 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  41.06 
 
 		 490 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  38.59 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  38.38 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  38.38 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  38.38 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  38.38 
 
 		 481 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  38.38 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  39.66 
 
 		 472 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  38.17 
 
 		 481 aa  292  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  41.56 
 
 		 483 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  37.98 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  39.22 
 
 		 474 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  39.44 
 
 		 483 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  40.1 
 
 		 568 aa  279  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  38.78 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  41.39 
 
 		 478 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  41.39 
 
 		 471 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  40.27 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  39.74 
 
 		 471 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  33.26 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  33.97 
 
 		 389 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  32.86 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  31.4 
 
 		 401 aa  200  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  35.47 
 
 		 387 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  36.55 
 
 		 409 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  30.02 
 
 		 394 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  30.02 
 
 		 394 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  31.11 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  31.48 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.21 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.98 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  30.75 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  30.75 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  30.75 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  30.75 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  30.93 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  30.02 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  28.93 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  36.62 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  31.07 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  34.04 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.16 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  34.04 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  30.27 
 
 		 397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  30.72 
 
 		 397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  33.51 
 
 		 447 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  28.07 
 
 		 396 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  33.11 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  31.64 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  30.17 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  35.07 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  29.97 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  30.37 
 
 		 393 aa  156  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  32.49 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  28.43 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  35.04 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  29.05 
 
 		 527 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  26.36 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  32.01 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  35.14 
 
 		 392 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  28.15 
 
 		 419 aa  146  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  29.07 
 
 		 527 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  37.05 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  33.33 
 
 		 393 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  33.33 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  33.33 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  30.56 
 
 		 398 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  34.15 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  33.7 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.2 
 
 		 274 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  33.45 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 		 449 aa  120  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  28.95 
 
 		 403 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  29.02 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  26.09 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0397  amidohydrolase  28.96 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  27.84 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  23.95 
 
 		 439 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4200  amidohydrolase  28.26 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  29.35 
 
 		 388 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  32.4 
 
 		 389 aa  92.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>