More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1518 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  100 
 
 		 490 aa  1011    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  54.81 
 
 		 509 aa  512  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  52.8 
 
 		 492 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  50.22 
 
 		 481 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  51.58 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  50 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  43.61 
 
 		 473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  40.29 
 
 		 483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  39.61 
 
 		 483 aa  320  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  41.6 
 
 		 483 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  40.49 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  39.58 
 
 		 481 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  37.5 
 
 		 474 aa  315  8e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  39.58 
 
 		 482 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  41.34 
 
 		 490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  38.67 
 
 		 475 aa  310  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  41.04 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  40.13 
 
 		 481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  39.78 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.78 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  39.78 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  40.22 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.78 
 
 		 481 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  39.83 
 
 		 454 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  41.29 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.57 
 
 		 481 aa  301  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.78 
 
 		 481 aa  299  9e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  39.52 
 
 		 485 aa  292  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  39.16 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  39.07 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  39.33 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  36.2 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  40.44 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  39.57 
 
 		 473 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  40.44 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  37.78 
 
 		 478 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  40.52 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  33.11 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  32.48 
 
 		 568 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  33.89 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  32.74 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.96 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  32.74 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  32.74 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  32.52 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.3 
 
 		 401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  32.3 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.15 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  29.69 
 
 		 389 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  32.75 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  31.31 
 
 		 388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  29.67 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  28.31 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  29.08 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  28.96 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  34.1 
 
 		 409 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  28.26 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  28.26 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  37.04 
 
 		 386 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  32.7 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  36.67 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  31.58 
 
 		 393 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  34.46 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  30 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  29 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  30.4 
 
 		 393 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  30.4 
 
 		 393 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  29.27 
 
 		 402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  29.8 
 
 		 397 aa  147  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  28.57 
 
 		 397 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  28.3 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  30.61 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  29.12 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  25.23 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  30.65 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  30.3 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  30.14 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.79 
 
 		 274 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  30.25 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  31.65 
 
 		 391 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  31.86 
 
 		 392 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  29.04 
 
 		 384 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  28.81 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  30.06 
 
 		 399 aa  134  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  33.57 
 
 		 390 aa  133  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  32.4 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  25.76 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  26.27 
 
 		 527 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  26.56 
 
 		 527 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  34.11 
 
 		 408 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  26.19 
 
 		 403 aa  93.2  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  30.84 
 
 		 389 aa  90.9  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  30.17 
 
 		 403 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  25.38 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  28.47 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1379  amidohydrolase  25.26 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  29.74 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4200  amidohydrolase  28.57 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  30.82 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>