More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2871 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  100 
 
 		 396 aa  816    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  92.39 
 
 		 396 aa  763    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  78.43 
 
 		 397 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  78.09 
 
 		 397 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  92.13 
 
 		 396 aa  760    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  69.87 
 
 		 397 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  69.37 
 
 		 398 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  68.61 
 
 		 423 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  67.42 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  66.33 
 
 		 398 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  64.99 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  65.08 
 
 		 403 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  64.47 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  64.23 
 
 		 397 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  63.22 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  61.81 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  63.96 
 
 		 402 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  64.81 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  64.81 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  64.81 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  64.47 
 
 		 396 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  64.21 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  62.31 
 
 		 401 aa  521  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  62.06 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  61.42 
 
 		 401 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  62.44 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  57.44 
 
 		 389 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  56.17 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  56.42 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  52.67 
 
 		 387 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  56.6 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  52.67 
 
 		 387 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  53.55 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  52.42 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  53.44 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  52.42 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  53.18 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  53.69 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  51.65 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  53.69 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  52.67 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  53.69 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  51.65 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  53.44 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  50.64 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  50.76 
 
 		 387 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  50.64 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  50.64 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  50.38 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  50.64 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  50.64 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  50.64 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  50.64 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.87 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  51.02 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  50.64 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  51.83 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.87 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  50.64 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.87 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  50.25 
 
 		 387 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  51.17 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  52.91 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  49.36 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  51.94 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  52.04 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  49.49 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  51.05 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  50.89 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  51.4 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  51.91 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  49.1 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  49.62 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.75 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  49.62 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  53.42 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  51.65 
 
 		 396 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  48.85 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  51.91 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  48.87 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  50.13 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  48.73 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  47.49 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  51.95 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  50.13 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  48.73 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  48.73 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  50.52 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  49.35 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  49.48 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  49.36 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  49.61 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  50.25 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  49.24 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  49.11 
 
 		 395 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  49.23 
 
 		 389 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  50.12 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  47.94 
 
 		 399 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>