More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1661 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  100 
 
 
390 aa  784    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  56.53 
 
 
384 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  48.39 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  45.98 
 
 
393 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  45.98 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  45.98 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  45.82 
 
 
402 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  48.99 
 
 
399 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  46.15 
 
 
393 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  45.22 
 
 
402 aa  278  9e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  46.15 
 
 
392 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  45.3 
 
 
394 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  42.46 
 
 
418 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  41.64 
 
 
397 aa  246  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  41.03 
 
 
397 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  41.76 
 
 
447 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  43.08 
 
 
409 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  44.35 
 
 
403 aa  223  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  39.39 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  44.25 
 
 
415 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  36.44 
 
 
400 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  36.24 
 
 
401 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  38.87 
 
 
419 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  39.89 
 
 
423 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  38.86 
 
 
387 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  36.16 
 
 
394 aa  202  6e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  34.25 
 
 
389 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  40.11 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  36.54 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  39.44 
 
 
447 aa  200  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  34.94 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  34.94 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  34.36 
 
 
425 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  35.96 
 
 
401 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  35.96 
 
 
401 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  37.32 
 
 
393 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  34.55 
 
 
396 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.96 
 
 
401 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.24 
 
 
401 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  35.67 
 
 
401 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  35.67 
 
 
401 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  35.67 
 
 
401 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  40.63 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.96 
 
 
401 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  40.11 
 
 
395 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  37 
 
 
393 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  32.78 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  36.81 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  29.29 
 
 
509 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  38.55 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  32.96 
 
 
481 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  35.77 
 
 
481 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  32.09 
 
 
492 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  33.22 
 
 
493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  35.06 
 
 
484 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  40.88 
 
 
414 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  32.23 
 
 
483 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  34.77 
 
 
482 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  35.13 
 
 
481 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  37.05 
 
 
483 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  36.3 
 
 
473 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  33.57 
 
 
490 aa  143  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  36.9 
 
 
493 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  30.29 
 
 
398 aa  136  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  33.21 
 
 
490 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  34.31 
 
 
474 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  32.84 
 
 
485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  30.64 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  33.33 
 
 
481 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  33.33 
 
 
454 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  33.33 
 
 
481 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  33.33 
 
 
481 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  31.91 
 
 
472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  33.33 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  33.33 
 
 
481 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  35.16 
 
 
473 aa  127  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  33.33 
 
 
481 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  33.33 
 
 
481 aa  126  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  33.33 
 
 
481 aa  126  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  33.45 
 
 
483 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  31.62 
 
 
474 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  36.39 
 
 
473 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  26.56 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  32.6 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  26.65 
 
 
389 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  31.77 
 
 
483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  32.73 
 
 
478 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.6 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  30.33 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  36.2 
 
 
471 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  35.25 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  26.85 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  36.2 
 
 
471 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  27.04 
 
 
568 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  32.26 
 
 
396 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  32.14 
 
 
387 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  31.94 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  30 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  30.88 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  31.23 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>