More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0521 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  89.42 
 
 
397 aa  698    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  90.43 
 
 
447 aa  707    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  100 
 
 
397 aa  819    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  43.81 
 
 
388 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  41.12 
 
 
418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  38.16 
 
 
393 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  40.05 
 
 
419 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  37.89 
 
 
393 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  37.89 
 
 
393 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  40.3 
 
 
401 aa  275  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  37.53 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  41.67 
 
 
409 aa  273  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  37.53 
 
 
393 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.55 
 
 
401 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  38.58 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  35.92 
 
 
387 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.15 
 
 
401 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  37.15 
 
 
396 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  40.71 
 
 
401 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  39.9 
 
 
401 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  38.85 
 
 
400 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  39.8 
 
 
401 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.25 
 
 
401 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  39.78 
 
 
402 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  39.8 
 
 
401 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  39.8 
 
 
401 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  38.28 
 
 
394 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  38.28 
 
 
394 aa  260  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  37.66 
 
 
394 aa  258  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  38.46 
 
 
391 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  38.2 
 
 
392 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  39.22 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  37.96 
 
 
387 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  40.51 
 
 
390 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  36.51 
 
 
389 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  39.2 
 
 
447 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  37.6 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  37.59 
 
 
392 aa  242  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  33.98 
 
 
425 aa  239  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  35.42 
 
 
384 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  38.36 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  38.32 
 
 
398 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  38.75 
 
 
449 aa  229  6e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  37.1 
 
 
414 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  36.52 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  32.48 
 
 
393 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  31.07 
 
 
481 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  38.38 
 
 
403 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  31.19 
 
 
493 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  34.02 
 
 
441 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  35.94 
 
 
423 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  31.02 
 
 
509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  31.34 
 
 
492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  37.84 
 
 
415 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  36.44 
 
 
481 aa  199  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  38.01 
 
 
408 aa  195  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  30.5 
 
 
483 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  30.96 
 
 
474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  30.5 
 
 
493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  29.11 
 
 
473 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  31.39 
 
 
483 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  31.15 
 
 
484 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  32.06 
 
 
389 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  32.57 
 
 
389 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  31.39 
 
 
481 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  31.39 
 
 
481 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.43 
 
 
274 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  31.17 
 
 
481 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  31.17 
 
 
481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  31.17 
 
 
481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  31.17 
 
 
481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  31.17 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  30.13 
 
 
472 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  31.17 
 
 
481 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  31.25 
 
 
454 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  28.35 
 
 
490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  28.78 
 
 
451 aa  160  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  29.41 
 
 
472 aa  159  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  29.6 
 
 
485 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  28.44 
 
 
490 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  29.18 
 
 
474 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  29.56 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  27.94 
 
 
472 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  32.93 
 
 
482 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  28.85 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  32.44 
 
 
481 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  29.48 
 
 
439 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  33.33 
 
 
483 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  35.77 
 
 
483 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  26.62 
 
 
473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  27.84 
 
 
471 aa  136  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  27.68 
 
 
568 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  29.51 
 
 
478 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  30.85 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0374  amidohydrolase amhX  29.15 
 
 
371 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0311  amidohydrolase  29.15 
 
 
371 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0322  amidohydrolase  29.15 
 
 
371 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0327  amidohydrolase amhX  28.57 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0867486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0342  amidohydrolase amhX  28.57 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0436  amidohydrolase amhX  29.15 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>