More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2082 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  79.21 
 
 		 473 aa  701    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  76.17 
 
 		 471 aa  643    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 472 aa  973    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  78.98 
 
 		 471 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  65.6 
 
 		 474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  64.38 
 
 		 478 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  57.88 
 
 		 484 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  58.21 
 
 		 473 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  56.93 
 
 		 490 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  57.45 
 
 		 485 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  50.32 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  52.16 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  49.78 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  46.14 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  51.16 
 
 		 481 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  51.9 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  46.43 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.64 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.43 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.22 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  46.43 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  46.22 
 
 		 481 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.22 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  46.01 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  47.56 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  45.28 
 
 		 483 aa  382  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  45 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  41.34 
 
 		 473 aa  340  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  40.77 
 
 		 492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  40.88 
 
 		 474 aa  332  9e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  39.51 
 
 		 481 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  39.7 
 
 		 509 aa  322  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  40.44 
 
 		 490 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  39.74 
 
 		 483 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  39.07 
 
 		 493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  40.27 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  38.96 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  35.66 
 
 		 568 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  31.16 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  31.93 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  30.77 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  32.37 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.15 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  31.93 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  31.93 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.15 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.37 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  31.93 
 
 		 401 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  31.93 
 
 		 401 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  29.69 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  31.48 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  31.48 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  31.48 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  30 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  30 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  29.21 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  28.48 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  31.88 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  31.64 
 
 		 387 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  29.62 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  28.91 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  25.5 
 
 		 392 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  28 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  31.77 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  30.19 
 
 		 386 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  33.43 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  36.6 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  30.99 
 
 		 391 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  34.77 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  28.88 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.13 
 
 		 447 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  26.65 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  30.82 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  29.75 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  32.26 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  34.74 
 
 		 409 aa  143  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  30.69 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  25.69 
 
 		 396 aa  140  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  29.55 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  28.31 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  33.7 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  32.63 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.8 
 
 		 274 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  29.16 
 
 		 441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  28.99 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  30.66 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  36 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  25.54 
 
 		 527 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  24.69 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  27.43 
 
 		 403 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  24.78 
 
 		 449 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  32.03 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  27.82 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  25.26 
 
 		 389 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  24.57 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  28.91 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  25 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1243  M20/M25/M40 family peptidase  27.72 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0436  amidohydrolase amhX  26.62 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0436  amidohydrolase amhX  26.62 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>