More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  100 
 
 		 415 aa  809    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  47.89 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  47.89 
 
 		 393 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  47.89 
 
 		 393 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  47.84 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  47.03 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  46.27 
 
 		 392 aa  296  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  49.22 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  46.42 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  45.81 
 
 		 402 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  46.79 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  48.68 
 
 		 423 aa  280  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  42.17 
 
 		 418 aa  272  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  45.12 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  43.57 
 
 		 384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  48.81 
 
 		 408 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  41.32 
 
 		 386 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  43.82 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  42.94 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  37.82 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  39.11 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  36.91 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  36.32 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  36.07 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  39.47 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  37.77 
 
 		 397 aa  215  9e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  38.4 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  36.31 
 
 		 401 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  39.57 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  40.26 
 
 		 441 aa  209  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  36.31 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  36.61 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  38.83 
 
 		 481 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  34.19 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.54 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.81 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  35.43 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  35.23 
 
 		 401 aa  196  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.04 
 
 		 401 aa  196  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  35.01 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  35.01 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  34.48 
 
 		 401 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  35.28 
 
 		 394 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  35.28 
 
 		 394 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  35.49 
 
 		 394 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  32.96 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  39.15 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  31.65 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  30.26 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  36.31 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  34.65 
 
 		 449 aa  172  6.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  30.48 
 
 		 509 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  29.61 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  28.81 
 
 		 481 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  31.28 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  29.19 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  30.67 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  28.54 
 
 		 484 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  30.84 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  27.64 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  32.28 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  30.56 
 
 		 451 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.16 
 
 		 274 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  26.93 
 
 		 473 aa  123  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  30.02 
 
 		 473 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  24.86 
 
 		 389 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  28.43 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  25.47 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  27.67 
 
 		 490 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  32.03 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  26.83 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  27.91 
 
 		 472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  28.22 
 
 		 472 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  25.53 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  31.67 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  29.93 
 
 		 490 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  26.93 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  26.91 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  28.98 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  30.67 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  29.46 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  32.82 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.44 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.82 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  32.82 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.82 
 
 		 481 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.05 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  32.82 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  32.43 
 
 		 481 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  31.07 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.43 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  27.49 
 
 		 478 aa  96.3  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  29.04 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  33.45 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  32.01 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  30.26 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  29.49 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  33.09 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  29.49 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  29.49 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>