253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2913 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  100 
 
 
472 aa  966    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  85.04 
 
 
475 aa  832    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  65.1 
 
 
472 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  51.67 
 
 
483 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  51.05 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  50.63 
 
 
481 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  51.05 
 
 
481 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  50.63 
 
 
481 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  50.63 
 
 
481 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  50.74 
 
 
481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  50.63 
 
 
481 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  50.63 
 
 
481 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  52.49 
 
 
482 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  51.17 
 
 
481 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  50.74 
 
 
484 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  51.22 
 
 
454 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  52.24 
 
 
483 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  52.3 
 
 
483 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  49.26 
 
 
474 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  50.74 
 
 
485 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  50.32 
 
 
472 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  50.89 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  49.13 
 
 
473 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  48.12 
 
 
478 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  50.79 
 
 
473 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  51.54 
 
 
471 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  51.3 
 
 
471 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  43.52 
 
 
473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  41.08 
 
 
509 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  41.41 
 
 
492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  41.03 
 
 
493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  41.04 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  40.26 
 
 
474 aa  302  8.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  38.68 
 
 
481 aa  302  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  42.13 
 
 
483 aa  300  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  37.17 
 
 
451 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  39.95 
 
 
493 aa  262  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  33.41 
 
 
401 aa  196  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  32.46 
 
 
568 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  33.17 
 
 
400 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.41 
 
 
401 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  33.41 
 
 
401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  33.41 
 
 
401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.41 
 
 
401 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.57 
 
 
401 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  32.94 
 
 
401 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  33.17 
 
 
401 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  32.94 
 
 
401 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  33.9 
 
 
447 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  29.58 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  29.38 
 
 
388 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  33.81 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  28.67 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  31.59 
 
 
386 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  29.48 
 
 
393 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  26.88 
 
 
392 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  38.1 
 
 
387 aa  156  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  32.96 
 
 
414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.59 
 
 
447 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  30.09 
 
 
409 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  27.42 
 
 
394 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  27.42 
 
 
394 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  28.82 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  28.6 
 
 
393 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  28.6 
 
 
393 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  30.41 
 
 
397 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  33.22 
 
 
394 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  30.5 
 
 
397 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  34.4 
 
 
391 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  35.9 
 
 
481 aa  136  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  28.77 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  30.44 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  31.91 
 
 
399 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  28.83 
 
 
395 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  28.83 
 
 
394 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.75 
 
 
274 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  31.53 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  24.34 
 
 
396 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  30.97 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  31.67 
 
 
441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  28.18 
 
 
393 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  35.31 
 
 
423 aa  126  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  36.07 
 
 
408 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  31.49 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  25.88 
 
 
425 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  26.35 
 
 
527 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  30.33 
 
 
390 aa  113  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  32.81 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  24.28 
 
 
527 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  31.77 
 
 
384 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 
449 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  28.28 
 
 
415 aa  93.6  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  26.69 
 
 
389 aa  91.3  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  26.39 
 
 
389 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  27.86 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2632  amidohydrolase  28.57 
 
 
367 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4929  amidohydrolase amhX  28.34 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  26.97 
 
 
446 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0327  amidohydrolase amhX  25.61 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0867486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0374  amidohydrolase amhX  25.95 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>