More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2632 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2632  amidohydrolase  100 
 
 
367 aa  749    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0781  amidohydrolase  41.6 
 
 
369 aa  288  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0222793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0436  amidohydrolase amhX  41.37 
 
 
371 aa  278  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0436  amidohydrolase amhX  41.37 
 
 
371 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0389  amidohydrolase amhX  41.32 
 
 
371 aa  275  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0311  amidohydrolase  41.1 
 
 
371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4929  amidohydrolase amhX  41.05 
 
 
371 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0314  amidohydrolase  40.5 
 
 
371 aa  272  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0170762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0374  amidohydrolase amhX  40.55 
 
 
371 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0322  amidohydrolase  39.73 
 
 
371 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0327  amidohydrolase amhX  40.22 
 
 
371 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0867486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0342  amidohydrolase amhX  40.22 
 
 
371 aa  269  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0824  amidohydrolase  39.83 
 
 
389 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0305704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1714  amidohydrolase  40.39 
 
 
389 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  31.97 
 
 
379 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  32.82 
 
 
403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  31.48 
 
 
425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  32.82 
 
 
403 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  32.8 
 
 
394 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  32.63 
 
 
395 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  32.63 
 
 
395 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  32.63 
 
 
395 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  32.89 
 
 
395 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  32.33 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  32.63 
 
 
395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  32.9 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  30.16 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  32.22 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  28.8 
 
 
386 aa  146  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  33.6 
 
 
408 aa  145  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  31.65 
 
 
396 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  28.42 
 
 
402 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  31.11 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  31.85 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  33.33 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  30.24 
 
 
397 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  32.9 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  32.8 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  31.88 
 
 
405 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  30.1 
 
 
387 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  29.29 
 
 
438 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  30.96 
 
 
385 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  30.47 
 
 
394 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  29.35 
 
 
398 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  27.86 
 
 
398 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  29.95 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  29.52 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  31.91 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  30.31 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  27.25 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  30.45 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  28.61 
 
 
432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  30.31 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4601  amidohydrolase  29.97 
 
 
394 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0856359  hitchhiker  0.00046008 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  31.12 
 
 
389 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  29.52 
 
 
415 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  28.95 
 
 
390 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  29.52 
 
 
415 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5231  peptidase M20D, amidohydrolase  30.05 
 
 
394 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  31.1 
 
 
392 aa  136  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5628  amidohydrolase  30.05 
 
 
394 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509819  hitchhiker  0.00594833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  30.5 
 
 
398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  31.35 
 
 
396 aa  136  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  29.4 
 
 
391 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  29.84 
 
 
387 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  28.98 
 
 
400 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  29.32 
 
 
387 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  30.63 
 
 
391 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  29.58 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  30.49 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  30.13 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  29.62 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  28.74 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  31.13 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  30.24 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  30.24 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  30.24 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  27.99 
 
 
381 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  30.81 
 
 
387 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0058  peptidase M20D, amidohydrolase  33.93 
 
 
391 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  28.98 
 
 
394 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  28.65 
 
 
396 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  29.32 
 
 
395 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  30.42 
 
 
399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  29.29 
 
 
392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  30.65 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  30.65 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  29.77 
 
 
395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  27.87 
 
 
400 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.65 
 
 
396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  28.92 
 
 
401 aa  133  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.08 
 
 
379 aa  133  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  30.65 
 
 
396 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  30.65 
 
 
396 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  32.72 
 
 
407 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  30.65 
 
 
396 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  30.65 
 
 
396 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  28.95 
 
 
387 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1761  amidohydrolase  27.6 
 
 
394 aa  133  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  28.92 
 
 
401 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>