More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4827 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  100 
 
 
392 aa  778    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  86.77 
 
 
393 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  81.17 
 
 
393 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  80.66 
 
 
393 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  80.66 
 
 
393 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  74.81 
 
 
394 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  57.63 
 
 
402 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  56.43 
 
 
402 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  56.84 
 
 
391 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  56.18 
 
 
399 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  47.34 
 
 
384 aa  296  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  46.59 
 
 
390 aa  272  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  39.63 
 
 
418 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  46.27 
 
 
415 aa  265  8.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  45.43 
 
 
447 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  38.5 
 
 
397 aa  246  4e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  38.2 
 
 
397 aa  245  8e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  42.37 
 
 
409 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  40.83 
 
 
423 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  38.42 
 
 
419 aa  229  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  37.37 
 
 
394 aa  223  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  40.41 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  36.8 
 
 
388 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  34.88 
 
 
401 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  41.55 
 
 
408 aa  215  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  37.37 
 
 
386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  34.2 
 
 
400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.95 
 
 
401 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  34.95 
 
 
401 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  39.74 
 
 
387 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  35.45 
 
 
394 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  35.45 
 
 
394 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  34.69 
 
 
401 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  34.69 
 
 
401 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  37.18 
 
 
389 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  34.88 
 
 
401 aa  206  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.69 
 
 
401 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  34.44 
 
 
401 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.7 
 
 
401 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  38.86 
 
 
387 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  34.95 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  33.68 
 
 
396 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  37.54 
 
 
449 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  40.28 
 
 
414 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  35.98 
 
 
395 aa  186  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  39.39 
 
 
441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  32.98 
 
 
393 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  31.12 
 
 
392 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  34.02 
 
 
393 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  31.38 
 
 
484 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  34.15 
 
 
481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  29.17 
 
 
474 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  31.31 
 
 
473 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  33.23 
 
 
485 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  29.16 
 
 
509 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  31.09 
 
 
398 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  36.18 
 
 
482 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  32.12 
 
 
481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  35.86 
 
 
481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  33.7 
 
 
483 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  30.44 
 
 
472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  36.3 
 
 
472 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  33.88 
 
 
473 aa  139  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  31.86 
 
 
490 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  30.17 
 
 
472 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  30.87 
 
 
474 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  29.52 
 
 
475 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  32.08 
 
 
483 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  27.68 
 
 
493 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  30.67 
 
 
492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  25.96 
 
 
389 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  26.17 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.47 
 
 
274 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  31.75 
 
 
490 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  30.09 
 
 
473 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.09 
 
 
481 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  32.09 
 
 
481 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  32.53 
 
 
451 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  31.72 
 
 
481 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  31.72 
 
 
454 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  31.72 
 
 
481 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  31.72 
 
 
481 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  31.72 
 
 
481 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  31.8 
 
 
471 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  31.72 
 
 
481 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  31.72 
 
 
481 aa  123  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  29.74 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  27.72 
 
 
439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  30.33 
 
 
478 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  33.82 
 
 
483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  32.58 
 
 
483 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  31.34 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  27.84 
 
 
395 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  28.06 
 
 
447 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  29.92 
 
 
392 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  29.44 
 
 
568 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  30.37 
 
 
390 aa  94  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  32.73 
 
 
470 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  32.36 
 
 
471 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>