More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0466 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 451 aa  902    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  50.47 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  43.88 
 
 		 473 aa  333  5e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  40.46 
 
 		 509 aa  326  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  41.95 
 
 		 492 aa  323  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  39.64 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  40.93 
 
 		 493 aa  308  9e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  37.18 
 
 		 483 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  40.47 
 
 		 474 aa  299  9e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  38.85 
 
 		 481 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  38.85 
 
 		 481 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  38.85 
 
 		 481 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  38.85 
 
 		 481 aa  286  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  36.2 
 
 		 490 aa  285  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  38.85 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.397765 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.07 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  38.25 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  39.07 
 
 		 481 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  38.85 
 
 		 481 aa  283  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  40.62 
 
 		 473 aa  282  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  38.98 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  38.83 
 
 		 481 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  38.25 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.168621 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  39.68 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  39.01 
 
 		 472 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  37.58 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  37.17 
 
 		 472 aa  263  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  38.46 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  39.68 
 
 		 472 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  38.72 
 
 		 485 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  37.71 
 
 		 483 aa  256  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  34.83 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  37 
 
 		 483 aa  240  5e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  40.53 
 
 		 473 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  41.72 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  38.12 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  42.76 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  33.25 
 
 		 568 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  32.53 
 
 		 400 aa  183  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  29.1 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  30.65 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  31.97 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  26.91 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  30.44 
 
 		 388 aa  176  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  31.81 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.05 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  31.81 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.29 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  29.85 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  31.81 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  31.57 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.64 
 
 		 401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  31.33 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  28.54 
 
 		 394 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  28.54 
 
 		 394 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  29.27 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  31.82 
 
 		 409 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  32.3 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  30.24 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  30.71 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  26.48 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  29.9 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  28.05 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  25.87 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  30.65 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  32.54 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  31.64 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  36.59 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  31.76 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  33.67 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  31.71 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1423  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  27.74 
 
 		 527 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  29.31 
 
 		 387 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  31.72 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  29.06 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  30.65 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  28.04 
 
 		 419 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  34.58 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  27.73 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  33.2 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  31.73 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  34.38 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  32.42 
 
 		 393 aa  123  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  31.56 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  31.56 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  31.56 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0752  hypothetical protein  27.51 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.681409 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  30.03 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  34.92 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  35.25 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  27.91 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  33.1 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  23.38 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1067  hippurate hydrolase  26.5 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.956056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  29.6 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  30.74 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  25 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  27.59 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  26.86 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>