More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28770 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  100 
 
 
481 aa  959    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  51.67 
 
 
447 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  48.49 
 
 
441 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  40 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  40.89 
 
 
409 aa  256  7e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  34.89 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  33.33 
 
 
419 aa  199  7.999999999999999e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  34.29 
 
 
394 aa  196  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.79 
 
 
401 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  32.24 
 
 
401 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  32.79 
 
 
401 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  32.56 
 
 
401 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  32.02 
 
 
401 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  32.33 
 
 
401 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  29.79 
 
 
392 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  32.33 
 
 
401 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  32.33 
 
 
401 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  30.88 
 
 
400 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  36.27 
 
 
399 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  33.09 
 
 
386 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  34.07 
 
 
447 aa  186  8e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  35.57 
 
 
392 aa  186  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  34.96 
 
 
393 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.59 
 
 
401 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  35.96 
 
 
384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  34.57 
 
 
397 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  33.08 
 
 
393 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  37.78 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  33.08 
 
 
393 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  33.08 
 
 
393 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  31.45 
 
 
389 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  34.05 
 
 
395 aa  176  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  37.29 
 
 
414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  29.69 
 
 
396 aa  173  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  34.16 
 
 
387 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  32.29 
 
 
393 aa  170  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  31.36 
 
 
388 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  35.9 
 
 
390 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  33.48 
 
 
483 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  32.97 
 
 
393 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  33.72 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  33.33 
 
 
391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  34.42 
 
 
387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  33.72 
 
 
394 aa  163  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  32.27 
 
 
394 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  32.27 
 
 
394 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  32.64 
 
 
402 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03140  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 
449 aa  161  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  29.7 
 
 
493 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01980  amidohydrolase  34.78 
 
 
403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  32.54 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  28.3 
 
 
490 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  28.48 
 
 
483 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  34.9 
 
 
473 aa  149  9e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  34.42 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2913  amidohydrolase  31.57 
 
 
472 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.61288  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  31.48 
 
 
509 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  30.41 
 
 
425 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0398  amidohydrolase  34.32 
 
 
483 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1049  amidohydrolase  28.48 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390336  normal  0.0140122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  26.97 
 
 
481 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  28.88 
 
 
484 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3593  amidohydrolase  34.49 
 
 
408 aa  140  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2973  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.91 
 
 
274 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  27.71 
 
 
492 aa  136  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6644  amidohydrolase  33.55 
 
 
482 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.168621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0517  amidohydrolase  33.13 
 
 
483 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837147  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3518  amidohydrolase  30.03 
 
 
490 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  28.76 
 
 
398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2435  amidohydrolase  31.13 
 
 
481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2832  amidohydrolase  28.51 
 
 
475 aa  133  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0746462  normal  0.203024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0719  amidohydrolase  29.61 
 
 
473 aa  133  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.800133 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  37.34 
 
 
472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1984  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  26.53 
 
 
481 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.397765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01314  predicted peptidase, aminobenzoyl-glutamate utilization protein  26.33 
 
 
481 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2307  amidohydrolase  27.51 
 
 
454 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1453  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  26.33 
 
 
481 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2288  amidohydrolase  25.92 
 
 
481 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  32.01 
 
 
474 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01324  hypothetical protein  26.33 
 
 
481 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1549  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  26.33 
 
 
481 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1785  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  26.12 
 
 
481 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1580  aminobenzoyl-glutamate utilization protein B  26.12 
 
 
481 aa  124  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4053  amidohydrolase  30.65 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809989  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3087  amidohydrolase  31.4 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2082  putative peptidase M20D, amidohydrolase  27.23 
 
 
472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2450  amidohydrolase-like protein  22.86 
 
 
389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2765  amidohydrolase-like protein  22.86 
 
 
389 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  25.85 
 
 
439 aa  113  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5022  amidohydrolase  28.84 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4578  amidohydrolase  29.12 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1357  amidohydrolase  33.23 
 
 
471 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4763  amidohydrolase  29.04 
 
 
568 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0893  amidohydrolase  32.91 
 
 
471 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  28.01 
 
 
398 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  28.01 
 
 
398 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4687  amidohydrolase  29.25 
 
 
395 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  25.47 
 
 
400 aa  87.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  27.49 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  27.94 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>