More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0390 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0390  amidohydrolase  100 
 
 		 439 aa  907    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2037  Metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase-like protein  33.33 
 
 		 419 aa  236  7e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3279  amidohydrolase  27.57 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680166  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3053  amidohydrolase  27.69 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.616288  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0448  hydrolase, putative  30.73 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2614  amidohydrolase  29.57 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4291  amidohydrolase  30.02 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1611  amidohydrolase  29.97 
 
 		 393 aa  136  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13335  amidohydrolase amiB1 (aminohydrolase)  28.96 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6415  amidohydrolase  27.79 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2071  amidohydrolase  27.94 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0859637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2929  amidohydrolase  27.32 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3385  peptidase M20D, amidohydrolase  29.95 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0740695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4151  amidohydrolase  29.02 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1245  peptidase M20D, amidohydrolase  27.75 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1262  amidohydrolase  27.75 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.41943 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0521  amidohydrolase  29.73 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00476757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1272  amidohydrolase  27.47 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4827  amidohydrolase  28.1 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1740  amidohydrolase family protein  27.83 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2908  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  27.07 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3241  amidohydrolase family protein  27.32 
 
 		 401 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3197  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  27.49 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3230  amidohydrolase family protein  27.07 
 
 		 401 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00646823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3215  amidohydrolase family protein  26.83 
 
 		 401 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0160  amidohydrolase  26.28 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0619  amidohydrolase  27.69 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2041  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  27.07 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2981  M20/M25/M40 family peptidase  26.59 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.834424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3206  M20/M25/M40 family peptidase  26.59 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.080248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1544  amidohydrolase  26.4 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000070453  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_002936  DET0545  amidohydrolase family protein  27.17 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2169  amidohydrolase  26.72 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2207  amidohydrolase  26.72 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_486  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  26.9 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06640  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03710)  27.72 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.216893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2292  peptidase M20D, amidohydrolase  28.84 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0260  amidohydrolase  27.38 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33260  amidohydrolase  27.96 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0598  amidohydrolase  26.08 
 
 		 492 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1118  amidohydrolase  26.94 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00577385  normal  0.373406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2651  amidohydrolase  25.82 
 
 		 493 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0985  amidohydrolase  27.56 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  26.98 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1661  amidohydrolase  26.85 
 
 		 390 aa  103  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28770  amidohydrolase  29.37 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1350  amidohydrolase  26.69 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0120056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7039  amidohydrolase  26.59 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3534  amidohydrolase  26.45 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0187865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  25.78 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4177  amidohydrolase  25.11 
 
 		 509 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2669  amidohydrolase  24.23 
 
 		 392 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.76994  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06462  amidohydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11660)  23.61 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  24.58 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4060  amidohydrolase  25.22 
 
 		 474 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0380  amidohydrolase  27.09 
 
 		 384 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  27.3 
 
 		 396 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  25.94 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  24.55 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2027  amidohydrolase  26.86 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0315101  normal  0.0503578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  28.62 
 
 		 465 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  28.24 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  27.16 
 
 		 387 aa  93.6  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34470  amidohydrolase  28.99 
 
 		 441 aa  93.2  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0328118  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  28.62 
 
 		 465 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  28.62 
 
 		 466 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3876  amidohydrolase  26.87 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  25.91 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  25.06 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0758  amidohydrolase  27.7 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  25.62 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  24.62 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  26.32 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0345  amidohydrolase  23.95 
 
 		 483 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  25.42 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6529  peptidase M20D, amidohydrolase  25.36 
 
 		 472 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.886662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  25.06 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  24.3 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  27.3 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  26.74 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4239  amidohydrolase  28.26 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  26.32 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  25.63 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3334  amidohydrolase  27.37 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  28.01 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  28.67 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  28.32 
 
 		 465 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  28.32 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  24.93 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0466  peptidase M20D, amidohydrolase  23.38 
 
 		 451 aa  87  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.409531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4201  amidohydrolase  26.47 
 
 		 483 aa  87  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.888012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  24.18 
 
 		 415 aa  86.7  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  24.94 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4256  amidohydrolase  26.63 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  26.02 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  25.72 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  24.21 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  25.7 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  24.36 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1518  amidohydrolase  25.38 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>