More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3266 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  100 
 
 		 438 aa  895    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  61.6 
 
 		 480 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  57.18 
 
 		 449 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  53.5 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  51.96 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  52.97 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  53.5 
 
 		 465 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  53.65 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  52.58 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  53.63 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  50.99 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  50.98 
 
 		 438 aa  421  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  53.33 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  52.35 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  52.11 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  52.1 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  50.98 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  51.17 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  49.41 
 
 		 436 aa  401  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  52.28 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  49.02 
 
 		 449 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  46.74 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  46.23 
 
 		 447 aa  362  9e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.39 
 
 		 401 aa  288  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  37.41 
 
 		 390 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  40.35 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  37.31 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  36.49 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  37.32 
 
 		 403 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.21 
 
 		 391 aa  272  9e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  37.32 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  38.42 
 
 		 400 aa  272  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  38.56 
 
 		 395 aa  269  8e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  40.56 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  37.18 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  36.75 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  36.75 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  41.42 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  39.55 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  37.74 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.73 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  38.16 
 
 		 399 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  38.76 
 
 		 405 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  34.22 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  38.17 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  38.92 
 
 		 390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  37.22 
 
 		 411 aa  259  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  38.06 
 
 		 390 aa  259  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  34.99 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  37.81 
 
 		 389 aa  256  5e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  38.21 
 
 		 400 aa  256  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  41.83 
 
 		 396 aa  256  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  36.52 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  34.13 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  36.39 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  37.28 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  38.73 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  40.53 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  36.98 
 
 		 387 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  37.2 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  40.73 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  36.25 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  39.31 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.03 
 
 		 394 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  34.75 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  39.9 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  36.52 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  34.14 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  36.93 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2091  amidohydrolase  35.85 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  36.96 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  35.7 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  36.17 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  39.7 
 
 		 402 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  36.91 
 
 		 413 aa  244  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  37.25 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  36.27 
 
 		 403 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  35.02 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  35.02 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  39 
 
 		 443 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  37 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  38.1 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  36.46 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  37.25 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  36.34 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  37.17 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  37.89 
 
 		 379 aa  240  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  35.22 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  36.32 
 
 		 388 aa  239  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  37.97 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  37.91 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  37.63 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  38.46 
 
 		 446 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.81 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  34.32 
 
 		 391 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  36.29 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  35.26 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  36.64 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  36.64 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  35.4 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>