More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  100 
 
 		 410 aa  822    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  60.83 
 
 		 411 aa  485  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  55.24 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  56.95 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  52.97 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  52.79 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  59.84 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  51.28 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  50.12 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  51.79 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  48.51 
 
 		 412 aa  344  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  49.08 
 
 		 406 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  46.31 
 
 		 423 aa  322  7e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  44.67 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.2 
 
 		 391 aa  296  3e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  43.24 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  46.27 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  40.25 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  40.6 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  39.63 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  39.6 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.86 
 
 		 465 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.36 
 
 		 435 aa  272  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.9 
 
 		 380 aa  272  9e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.61 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.41 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  38.5 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  38.12 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  40.51 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  40.43 
 
 		 458 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  40.4 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  38.36 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  40.4 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  40.1 
 
 		 394 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.3 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  38.24 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  38.28 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  38.11 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  39.12 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  39.12 
 
 		 471 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  42.6 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  35.71 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  39.59 
 
 		 389 aa  259  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  38.82 
 
 		 439 aa  259  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  39.5 
 
 		 435 aa  258  9e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  37.85 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  41.75 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  39.68 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  39.95 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  38.58 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  38.88 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  37.06 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  40.27 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.26 
 
 		 405 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  40.71 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31131  predicted protein  38.29 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  39.3 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  37.81 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  35.88 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  40.69 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  35.45 
 
 		 423 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  40.66 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.39 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  33.59 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  38.85 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  37.09 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  37.09 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  33.59 
 
 		 403 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  35.06 
 
 		 387 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  39.03 
 
 		 430 aa  253  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  35.97 
 
 		 390 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  38.82 
 
 		 390 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  36.13 
 
 		 387 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.54 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  41.89 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  38.76 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  38.73 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  37.12 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  37.4 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  38 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  38.87 
 
 		 407 aa  249  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  39.08 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.2 
 
 		 391 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  38.56 
 
 		 390 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  36.58 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.58 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  37.63 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  40.68 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  39.88 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  39.58 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  36.39 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  38.56 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  38.56 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.13 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  36.57 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.46 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  37.17 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  39.43 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  33.84 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>