More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0678 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  100 
 
 		 394 aa  782    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  71.83 
 
 		 400 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  54.09 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  47.78 
 
 		 403 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  47.78 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  47.24 
 
 		 408 aa  352  8e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  43.9 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  44.85 
 
 		 405 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  43.9 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  47.04 
 
 		 404 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  44.33 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  44.78 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  43.32 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 393 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  41.24 
 
 		 390 aa  313  4.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  40.67 
 
 		 391 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  40.93 
 
 		 391 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.67 
 
 		 391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.67 
 
 		 391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.67 
 
 		 391 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  40.93 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.41 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.16 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  43.27 
 
 		 387 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  39.79 
 
 		 390 aa  305  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  40.31 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  39.38 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  43.39 
 
 		 387 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  40.96 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.19 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  42.59 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  44.33 
 
 		 389 aa  296  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  41.16 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  41.1 
 
 		 404 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.78 
 
 		 380 aa  294  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  44.3 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  39.27 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  45.1 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  43.34 
 
 		 387 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  45.9 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  42.25 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  41.56 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  42.93 
 
 		 396 aa  289  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  41.6 
 
 		 396 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  40.11 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  43.34 
 
 		 389 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  40.26 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  41.35 
 
 		 396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.21 
 
 		 403 aa  286  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  45.91 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  41.11 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  39.74 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  42.38 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  40.94 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  40.05 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  35.64 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  42.48 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  40.05 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  41.82 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  38.96 
 
 		 397 aa  282  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  37.47 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  42.33 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  40.53 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  40.21 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  42.9 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39.21 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  40.61 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1094  amidohydrolase  40.15 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  42.34 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  42.08 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  43.78 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  42.08 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  41.51 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  41.56 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  42.3 
 
 		 387 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  39.53 
 
 		 398 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  41.27 
 
 		 402 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  42.97 
 
 		 389 aa  278  9e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  43.16 
 
 		 390 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  39.19 
 
 		 396 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1532  aminoacylase  38.42 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  41.33 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  36.99 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  40.16 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  39.22 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  41.56 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  41.95 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  38.56 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  43.09 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.21 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  39.84 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  43.12 
 
 		 391 aa  277  3e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  42 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  43.16 
 
 		 405 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3928  amidohydrolase  44.5 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  38.78 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1205  amidohydrolase  38.78 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.811982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  40.36 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1296  amidohydrolase  37.5 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>