More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4861 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  100 
 
 
396 aa  794    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  62.94 
 
 
399 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  57.63 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  62.74 
 
 
454 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  55 
 
 
407 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  55.09 
 
 
410 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  57.36 
 
 
406 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  54.73 
 
 
429 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  53.85 
 
 
411 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  51.48 
 
 
423 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  51.28 
 
 
410 aa  362  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  49.36 
 
 
402 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  55.3 
 
 
505 aa  344  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  47.81 
 
 
394 aa  323  3e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  52.73 
 
 
401 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  46.73 
 
 
399 aa  316  4e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  43.47 
 
 
400 aa  279  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  44.14 
 
 
393 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  41.67 
 
 
396 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  39.59 
 
 
397 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  41.3 
 
 
395 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  40.15 
 
 
396 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.42 
 
 
379 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  41.04 
 
 
395 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  40.62 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  40.62 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  42.51 
 
 
396 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  40.62 
 
 
395 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  37.06 
 
 
390 aa  265  8.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  41.15 
 
 
389 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  39.15 
 
 
397 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  41.78 
 
 
388 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  39.9 
 
 
396 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  36.32 
 
 
394 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  41.81 
 
 
458 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.24 
 
 
387 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  37.9 
 
 
431 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  37.63 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  40.81 
 
 
387 aa  262  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  41.04 
 
 
388 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  39.61 
 
 
459 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  38.73 
 
 
387 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  43.64 
 
 
394 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  38.25 
 
 
396 aa  259  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  37 
 
 
398 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  41.25 
 
 
390 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  37.25 
 
 
435 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  41.04 
 
 
388 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  40.26 
 
 
408 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  41 
 
 
388 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  41.04 
 
 
388 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  40.05 
 
 
387 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  37.75 
 
 
397 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  40.05 
 
 
396 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.8 
 
 
438 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  39.25 
 
 
396 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  41.34 
 
 
391 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  38.8 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  37.97 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  37.97 
 
 
401 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  37.59 
 
 
397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  41.04 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  40.48 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  39.24 
 
 
404 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  40.36 
 
 
389 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  38.93 
 
 
391 aa  253  5.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  37.75 
 
 
401 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  40.57 
 
 
395 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  39.9 
 
 
439 aa  252  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  37.53 
 
 
403 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  36.91 
 
 
398 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  38.82 
 
 
386 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  36.48 
 
 
404 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  40.63 
 
 
391 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  40.45 
 
 
389 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  37.53 
 
 
403 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  36.76 
 
 
437 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  40.43 
 
 
389 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  41.27 
 
 
385 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.73 
 
 
394 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  39.31 
 
 
438 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  39.48 
 
 
406 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  39.14 
 
 
388 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  38.32 
 
 
389 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  37.84 
 
 
397 aa  249  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  36.62 
 
 
405 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  39.25 
 
 
387 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  38.37 
 
 
394 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  41.27 
 
 
385 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  38.29 
 
 
388 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  39.1 
 
 
389 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  41.52 
 
 
385 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  36.98 
 
 
405 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  40.05 
 
 
396 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  40.1 
 
 
390 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  40.31 
 
 
394 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  39.5 
 
 
390 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  40.31 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.26 
 
 
405 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  37 
 
 
423 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>