More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3159 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  78.09 
 
 		 396 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  77.72 
 
 		 396 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  88.41 
 
 		 397 aa  746    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  77.47 
 
 		 396 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 397 aa  820    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  69.87 
 
 		 423 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  69.11 
 
 		 398 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  67.85 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  69.37 
 
 		 398 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  66.67 
 
 		 396 aa  570  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  66.58 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  66.5 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  65.74 
 
 		 397 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  66.08 
 
 		 403 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  64.07 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  64.99 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  65.08 
 
 		 401 aa  542  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  63.45 
 
 		 402 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  64.82 
 
 		 401 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  63.8 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  63.8 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  63.8 
 
 		 396 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  63.45 
 
 		 396 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  61.68 
 
 		 401 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  65.41 
 
 		 402 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  63.2 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  57.43 
 
 		 401 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  56.4 
 
 		 389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  54.61 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  55.84 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  52.36 
 
 		 387 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  52.62 
 
 		 387 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  52.88 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  51.83 
 
 		 387 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  52.36 
 
 		 387 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  52.36 
 
 		 387 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  50.64 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  50.64 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  54.01 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  50.64 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  50.64 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  51.57 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  50.51 
 
 		 392 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  49.87 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  50.13 
 
 		 406 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  49.62 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  49.62 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  49.62 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  49.62 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  49.87 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  49.62 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  51.02 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  49.62 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  49.62 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  49.62 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  51.57 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  51.39 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  49.11 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  52.3 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  51.15 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  48.21 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  50.52 
 
 		 391 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  51.64 
 
 		 387 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  48.85 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  50.64 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 412 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  50.25 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  50.26 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.98 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  48.97 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  48.84 
 
 		 390 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  50.25 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  50.38 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  49.87 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  47.84 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  49.11 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  51.04 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  48.71 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  50.64 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  48.74 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  50.64 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  48.1 
 
 		 388 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  50.38 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  50.25 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  50.89 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.12 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  52.74 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  50 
 
 		 379 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  48.04 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  49.35 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  49.23 
 
 		 386 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  50.13 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  49.5 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  48.23 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  48.48 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  48.96 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  50.38 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  50.25 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  49.62 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>