More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1734 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  81.54 
 
 		 390 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  79.43 
 
 		 389 aa  638    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 389 aa  793    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  82.56 
 
 		 390 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  93.08 
 
 		 390 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  81.73 
 
 		 394 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  78.41 
 
 		 389 aa  619  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  63.75 
 
 		 389 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  64.45 
 
 		 390 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  63.08 
 
 		 387 aa  504  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  63.92 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  64.87 
 
 		 388 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  63.94 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  62.82 
 
 		 387 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  60.05 
 
 		 387 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  62.31 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  62.31 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  59.54 
 
 		 387 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  61.44 
 
 		 387 aa  491  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  62.31 
 
 		 387 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  62.56 
 
 		 388 aa  487  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  61.08 
 
 		 388 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  62.05 
 
 		 388 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  62.05 
 
 		 390 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  59.49 
 
 		 387 aa  481  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  60 
 
 		 387 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  64.1 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  61.34 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  60.05 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  60.31 
 
 		 390 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  57.18 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  61.34 
 
 		 389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  57.44 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  56.93 
 
 		 390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  53.51 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  53.51 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  51.5 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  53.11 
 
 		 388 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  51.04 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  51.25 
 
 		 396 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  56.7 
 
 		 389 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  50.5 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  52.33 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  52.47 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  50.25 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  51.72 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.37 
 
 		 398 aa  391  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  52.73 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  50.25 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  51.55 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.5 
 
 		 404 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  52.97 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  49.48 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  49.12 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  50.52 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  48.63 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  50.78 
 
 		 387 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.26 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  51.81 
 
 		 391 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  51.17 
 
 		 387 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  50.26 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  51.17 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.26 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  51.56 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  51.17 
 
 		 387 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  50.64 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  50.38 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  50.38 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  50.64 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  48.84 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  50.64 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  50.92 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.23 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.38 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  50.38 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  50.38 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.91 
 
 		 401 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  50.9 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  48.72 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.26 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  47.12 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.84 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  51.85 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  50.13 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  50.38 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.64 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  47.61 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  48.6 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  50.26 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  50.13 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  48.6 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  47.45 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  51.03 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  48.6 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  50.13 
 
 		 406 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.85 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.25 
 
 		 398 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  49.87 
 
 		 399 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  51.28 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  48.23 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>