More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3506 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  100 
 
 		 401 aa  782    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  62.37 
 
 		 411 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  58.88 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  53.67 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  54.18 
 
 		 399 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  57.77 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  53.32 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  52.62 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  50.75 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  51.65 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  50.63 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  50.86 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  50.26 
 
 		 406 aa  332  6e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  48.62 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  47.72 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  48.94 
 
 		 393 aa  309  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  51.44 
 
 		 505 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0877  amidohydrolase  43.26 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  38.01 
 
 		 390 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.52 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  44.13 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  38.34 
 
 		 393 aa  276  4e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  43.57 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  45.17 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  44.91 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  45.38 
 
 		 388 aa  273  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  39.58 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  44.19 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  40.93 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  42.49 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  41.3 
 
 		 379 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  41.76 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  42.26 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  41.15 
 
 		 401 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  40.2 
 
 		 412 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  37.06 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  40.06 
 
 		 394 aa  266  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  38.65 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  41.88 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  40.58 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  41.76 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  40.88 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.64 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  39.69 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  40.79 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  41.77 
 
 		 387 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.75 
 
 		 438 aa  262  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  43.92 
 
 		 399 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  43.9 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  43.04 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  45.86 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  36.03 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  42.04 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  35.68 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  40.82 
 
 		 403 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  41.69 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  39.02 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  41.15 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  41.16 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  40.78 
 
 		 447 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  39.31 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  37.5 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  35.68 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  40.91 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  43.23 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  37.53 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  40.62 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.85 
 
 		 465 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  40.94 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  40.79 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  40.62 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  38.38 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  36.34 
 
 		 431 aa  256  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.6 
 
 		 465 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  39.58 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  42.86 
 
 		 390 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.45 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  42.86 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  41.65 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  44.94 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  41.64 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  44.36 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  37.88 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  40.21 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  41.04 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  39.32 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  42.08 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  38.44 
 
 		 480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  38.79 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  41.49 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  39.47 
 
 		 387 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  39.32 
 
 		 397 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  39.27 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  40.16 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  41.44 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  41.44 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  38.79 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  40.96 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  38.6 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  39.47 
 
 		 387 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>