More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3187 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0245  amidohydrolase  88.14 
 
 		 388 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3187  amidohydrolase  100 
 
 		 388 aa  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  69.59 
 
 		 388 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  67.96 
 
 		 390 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  69.07 
 
 		 388 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  69.59 
 
 		 390 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  65.45 
 
 		 395 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  64.01 
 
 		 390 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  64.87 
 
 		 389 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  62.37 
 
 		 389 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  62.53 
 
 		 388 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  63.68 
 
 		 390 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  63.8 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  60.62 
 
 		 387 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  61.14 
 
 		 387 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  62.05 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  63.33 
 
 		 389 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1288  amidohydrolase  62.89 
 
 		 388 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0866095  normal  0.389955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  61.08 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  60.93 
 
 		 390 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  61.34 
 
 		 387 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  63.43 
 
 		 390 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  61.34 
 
 		 387 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  60.82 
 
 		 387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3289  peptidase M20D, amidohydrolase  60.15 
 
 		 387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.286044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  61.89 
 
 		 390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  60.82 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  60.72 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0610  amidohydrolase  64.69 
 
 		 389 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00962709  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  59.13 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0718  peptidase M20D, amidohydrolase  58.61 
 
 		 390 aa  454  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.178083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  61.86 
 
 		 387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  57.51 
 
 		 387 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  54.78 
 
 		 388 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  54.78 
 
 		 388 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  56.85 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  54.12 
 
 		 386 aa  413  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  52.58 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  54.52 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3086  peptidase M20D, amidohydrolase  56.07 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.985379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  55.47 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  50.75 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  52.11 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  55.47 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  49.87 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  54.95 
 
 		 388 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  54.29 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  53.95 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5260  putative amidohydrolase family protein  51.55 
 
 		 387 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0497165  normal  0.313624 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  52.71 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  56.51 
 
 		 385 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.62 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  53.95 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  54.35 
 
 		 404 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4317  amidohydrolase  56.25 
 
 		 385 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0319433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.87 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.87 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  52.14 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5679  amidohydrolase  53.02 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  52.14 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  52.14 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2323  amidohydrolase  56.25 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.462875 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.62 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  51.89 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  51.89 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  51.72 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  48.25 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1193  peptidase M20D, amidohydrolase  50.65 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  46.93 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  49.21 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.4 
 
 		 387 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  48.36 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  51.66 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  51.66 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  51.66 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  52.17 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  51.66 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.46 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  51.66 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  51.66 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  51.29 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  51.66 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.13 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  49.21 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  52.41 
 
 		 395 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  52.41 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  48.36 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  51.19 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  47.52 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  47.49 
 
 		 401 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 390 aa  362  9e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  47.24 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  46.37 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  52.59 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  50.78 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  49.87 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  47.37 
 
 		 397 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  49.87 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  49.87 
 
 		 387 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>