More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7975 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  100 
 
 
412 aa  825    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  57.63 
 
 
396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  57.52 
 
 
410 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  56.8 
 
 
407 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  56.93 
 
 
399 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  54.07 
 
 
454 aa  364  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  51.49 
 
 
406 aa  361  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  50 
 
 
429 aa  354  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  49.01 
 
 
411 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  48.51 
 
 
410 aa  329  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  45.04 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  44.89 
 
 
423 aa  318  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  45.37 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  46.32 
 
 
505 aa  299  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  48.56 
 
 
401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  42.08 
 
 
394 aa  278  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.1 
 
 
379 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  41.25 
 
 
393 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  36.85 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  39 
 
 
406 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  38.65 
 
 
395 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  36.62 
 
 
396 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  38.4 
 
 
395 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  38.4 
 
 
395 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  38.4 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  38.4 
 
 
395 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  38.4 
 
 
395 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  38.6 
 
 
396 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  35.04 
 
 
387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  35.77 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  36.08 
 
 
396 aa  232  8.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  37.69 
 
 
388 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  37.19 
 
 
391 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  37.69 
 
 
388 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  38.26 
 
 
458 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  37.69 
 
 
389 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  37.17 
 
 
398 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  34.39 
 
 
400 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  36.95 
 
 
396 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  37.75 
 
 
391 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  33.09 
 
 
390 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  35.64 
 
 
388 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  36.36 
 
 
396 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  36.36 
 
 
402 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  35 
 
 
387 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  38.85 
 
 
405 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  33.08 
 
 
400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  36.01 
 
 
388 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  38 
 
 
391 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  36.12 
 
 
397 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0991  amidohydrolase  35.84 
 
 
405 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  35.68 
 
 
389 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  37.16 
 
 
387 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  36.66 
 
 
395 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  37.71 
 
 
396 aa  223  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  36.71 
 
 
388 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  36.7 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0654  M20/M25/M40 family peptidase  32.2 
 
 
390 aa  222  7e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  36.43 
 
 
402 aa  223  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  35.96 
 
 
394 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  36.56 
 
 
388 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  36.41 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  35.98 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  35.98 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  37.78 
 
 
413 aa  220  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  35.63 
 
 
397 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  35.75 
 
 
396 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  35.71 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  36.23 
 
 
389 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2785  amidohydrolase  31.53 
 
 
385 aa  219  5e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000905599  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  35.84 
 
 
394 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  35.84 
 
 
394 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  35.22 
 
 
394 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  35.84 
 
 
394 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  35.58 
 
 
399 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  35.92 
 
 
387 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  36.39 
 
 
425 aa  219  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  35.71 
 
 
396 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  35.71 
 
 
396 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  35.71 
 
 
396 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  35.22 
 
 
394 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  34.1 
 
 
401 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  34.98 
 
 
396 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  34.98 
 
 
396 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  34.98 
 
 
396 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  34.47 
 
 
387 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  34.48 
 
 
398 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  36.25 
 
 
390 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  34.98 
 
 
396 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  34.16 
 
 
389 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  35.25 
 
 
390 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  34.1 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  35.8 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  33.51 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  34.62 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  33.58 
 
 
391 aa  217  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  35.29 
 
 
393 aa  217  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1139  amidohydrolase  31.44 
 
 
385 aa  217  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  35.71 
 
 
397 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  37.28 
 
 
399 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>