More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2379 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  100 
 
 		 402 aa  814    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  80.36 
 
 		 390 aa  644    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  76.41 
 
 		 392 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  63.42 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  61.84 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  62.11 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  61.94 
 
 		 389 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  62.11 
 
 		 387 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  62.11 
 
 		 387 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  60.63 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  62.11 
 
 		 387 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  61.32 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  61.58 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  60.79 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  61.94 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  61.52 
 
 		 406 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  61.42 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  61.68 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  56.92 
 
 		 412 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  61.42 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  58.85 
 
 		 395 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  60.63 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  60.1 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  60.63 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  62.23 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  61.68 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  60.1 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  61.68 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  61.68 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  61.42 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  60.63 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  60.1 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  59.58 
 
 		 389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  61.42 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  60.89 
 
 		 389 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  62.23 
 
 		 391 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  61.01 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  61.84 
 
 		 373 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  61.01 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  61.68 
 
 		 389 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  59.79 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  57.33 
 
 		 399 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  59.73 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  60.05 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  59.46 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  59.46 
 
 		 396 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  56.78 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  58.99 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  59.46 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  56.81 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  58.92 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  61.15 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  60.21 
 
 		 391 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  56.1 
 
 		 393 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  59.29 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  59.19 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  56.49 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  53.73 
 
 		 403 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  56.28 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3289  peptidase M20D, amidohydrolase  55.73 
 
 		 404 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  57.76 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  58.27 
 
 		 395 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  54.71 
 
 		 407 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0476  amidohydrolase family protein  61.38 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.504077  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1494  hippurate hydrolase  61.21 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1808  peptidase  61.21 
 
 		 753 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  55.61 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0378  amidohydrolase family protein  61.21 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  58.22 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0794  hippurate hydrolase  61.21 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2111  hippurate hydrolase  61.21 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216397  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5812  peptidase M20D, amidohydrolase  58.95 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.586057  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4507  hippurate hydrolase  54.2 
 
 		 403 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  58.35 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  58.35 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  58.35 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1410  amidohydrolase  55.22 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1452  amidohydrolase  55.47 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  51.82 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  51.51 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  53.4 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1302  amidohydrolase  58.14 
 
 		 409 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.580399  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5419  peptidase, M20D subfamily  55.27 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.880964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  51.52 
 
 		 385 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  48.87 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  51.31 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  50.52 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  47.51 
 
 		 404 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  47.99 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.37 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  54.16 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  49.87 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.37 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  53.7 
 
 		 388 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  47.15 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  47.36 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  52.22 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.61 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  47.87 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  48.18 
 
 		 402 aa  364  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>