More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3776 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3433  amidohydrolase  79.71 
 
 		 410 aa  673    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3776  amidohydrolase  100 
 
 		 407 aa  824    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7680  Hippurate hydrolase  59.15 
 
 		 399 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7975  amidohydrolase  56.8 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  55 
 
 		 396 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  52.79 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  53.1 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02420  amidohydrolase  48.28 
 
 		 429 aa  355  5.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  50.25 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23130  amidohydrolase  47.45 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0836902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  47.21 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  42.89 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  44.22 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3506  amidohydrolase  51.47 
 
 		 401 aa  302  8.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  42.49 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2847  amidohydrolase  47.57 
 
 		 505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  37.47 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  37.56 
 
 		 413 aa  247  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  36.25 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  37.53 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  37.53 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  35.5 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  36.5 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  35.7 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  35.5 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  35.53 
 
 		 387 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  35.53 
 
 		 387 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  38 
 
 		 391 aa  239  6.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  36.2 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  35.44 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  35.78 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  35.25 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  34.71 
 
 		 403 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  36.63 
 
 		 406 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  35.32 
 
 		 388 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  35.44 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  37.02 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  37.21 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  34.94 
 
 		 387 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  35.19 
 
 		 387 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  34.56 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  36.32 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  35.82 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  35.28 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  35.24 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  33.81 
 
 		 423 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  34.72 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  35.84 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  36.22 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  34.47 
 
 		 390 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  33.92 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  36.22 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  36.22 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  37.78 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  32.59 
 
 		 390 aa  229  7e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  37.38 
 
 		 405 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  35.75 
 
 		 395 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  34.56 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  33.67 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  35.68 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  35.05 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1002  amidohydrolase family protein  35.47 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000070505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  37.7 
 
 		 391 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  35.15 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.03 
 
 		 438 aa  226  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  37.56 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  35.44 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  36.34 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  35.68 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  34.38 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  34.58 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5569  amidohydrolase  35.61 
 
 		 401 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  35.97 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  35.2 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  34.14 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  37.34 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  34.56 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  36.13 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  33.76 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  33.5 
 
 		 405 aa  222  9e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  34.41 
 
 		 480 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  35.41 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  34.7 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  34.45 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  35.94 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  34.64 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  34.64 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  36.67 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  34.19 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  34.7 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  34.7 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  34.19 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  34.7 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  34.19 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  34.19 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  36.43 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  36.41 
 
 		 399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  33.16 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  34.45 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>