More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3688 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  82.42 
 
 		 438 aa  718    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  100 
 
 		 439 aa  891    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  60.14 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  59.68 
 
 		 465 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  62.31 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  58.81 
 
 		 435 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  58 
 
 		 437 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  59.45 
 
 		 471 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  59.45 
 
 		 465 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  59.27 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  59 
 
 		 471 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  60.42 
 
 		 435 aa  484  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  53.6 
 
 		 431 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  52.55 
 
 		 449 aa  461  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  50.75 
 
 		 480 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  50.71 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  49.28 
 
 		 459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  49.19 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  51.02 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  43.42 
 
 		 432 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  48.63 
 
 		 447 aa  362  6e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  47.58 
 
 		 449 aa  362  7.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  45.94 
 
 		 431 aa  337  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  42.93 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  41.39 
 
 		 411 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  40.38 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  41.06 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  39.85 
 
 		 394 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  39.22 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  41.94 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  41.37 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  39.85 
 
 		 404 aa  270  5e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  42.41 
 
 		 379 aa  270  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  40.41 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  41.42 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  39.23 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  38.41 
 
 		 399 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  39.9 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.69 
 
 		 401 aa  266  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  38.97 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  36.2 
 
 		 446 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  37.06 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  36.52 
 
 		 405 aa  263  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  41.33 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  41 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.97 
 
 		 400 aa  260  4e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  36.86 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  37.84 
 
 		 390 aa  260  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  37.93 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.46 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  35.49 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  38.15 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  37.91 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  35.49 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  40.49 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  37.16 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  38.2 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  43.65 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  36.14 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  38.37 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  36.92 
 
 		 408 aa  256  7e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  37.69 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  37.5 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  38.35 
 
 		 410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  41.27 
 
 		 454 aa  252  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  38.55 
 
 		 402 aa  252  8.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  39.02 
 
 		 393 aa  252  9.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  35.92 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  39.9 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  36.8 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  40.1 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  37.66 
 
 		 395 aa  251  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  38.5 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  38.16 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  36.8 
 
 		 395 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  41.49 
 
 		 384 aa  249  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  37.1 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  35.34 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  36.56 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  36.56 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  39.2 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  35.4 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  36.56 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  38.35 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  39.58 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  37.01 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  34.87 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  39 
 
 		 387 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  38.98 
 
 		 443 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  35.73 
 
 		 405 aa  246  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  36.97 
 
 		 441 aa  246  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  38.64 
 
 		 384 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  36.49 
 
 		 470 aa  246  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  36.57 
 
 		 430 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  36.26 
 
 		 471 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  37.79 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  36.36 
 
 		 400 aa  243  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  40.15 
 
 		 397 aa  243  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  35.84 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  38.76 
 
 		 393 aa  242  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>