More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2688 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  69.98 
 
 		 446 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  71.53 
 
 		 446 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  100 
 
 		 445 aa  906    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  71.26 
 
 		 441 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  49.88 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  49.08 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  47.31 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  48.89 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  46.67 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  46.49 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  47.61 
 
 		 430 aa  360  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  46.92 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  46.04 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  42.45 
 
 		 419 aa  332  6e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  43.75 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  43.75 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  40.68 
 
 		 470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  41.15 
 
 		 471 aa  312  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  42.37 
 
 		 424 aa  309  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  42.57 
 
 		 420 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  41.39 
 
 		 420 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  41.67 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  39.44 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  41.5 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  40.52 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  40.58 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  45.61 
 
 		 427 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  37.47 
 
 		 1270 aa  286  5e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  41.67 
 
 		 405 aa  279  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  43.24 
 
 		 575 aa  279  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  42.89 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  41.79 
 
 		 416 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  42.64 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  42.64 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  38.93 
 
 		 450 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  41.3 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  39.56 
 
 		 442 aa  259  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  38.9 
 
 		 435 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  37.12 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  38.78 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.57 
 
 		 438 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  39.51 
 
 		 439 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  42.18 
 
 		 367 aa  250  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  37.69 
 
 		 410 aa  250  5e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  37.72 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  40.68 
 
 		 426 aa  247  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.79 
 
 		 403 aa  246  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  41.08 
 
 		 437 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  38.65 
 
 		 437 aa  245  9e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  39.04 
 
 		 653 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  40.99 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  35.53 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  37.77 
 
 		 421 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  40.52 
 
 		 412 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  40.43 
 
 		 426 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  41.26 
 
 		 379 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  35.29 
 
 		 399 aa  242  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  40.23 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  34.42 
 
 		 465 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  36.62 
 
 		 470 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  35.53 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  38.69 
 
 		 437 aa  239  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  37.68 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  37.56 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  34.2 
 
 		 471 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  33.57 
 
 		 390 aa  237  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  38.9 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  41.76 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  38.64 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  40.68 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  39.78 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  37.44 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  36.41 
 
 		 390 aa  233  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  36.75 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  36.68 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  36.51 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  38.63 
 
 		 419 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  39.71 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  39.71 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  39.43 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  36.86 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  35.32 
 
 		 389 aa  229  9e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  36.75 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  41.07 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  34.92 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  40.69 
 
 		 389 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  40.59 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  35.29 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  39.1 
 
 		 397 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  39.14 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  40.11 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  35.96 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  36.73 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.33 
 
 		 401 aa  225  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  38.95 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  40.11 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  34.56 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  39.59 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  36.66 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  38.1 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>