More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0543 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  100 
 
 
427 aa  851    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  55.88 
 
 
424 aa  438  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  57.52 
 
 
431 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  56 
 
 
420 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  52.36 
 
 
421 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  55.45 
 
 
450 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  55.72 
 
 
420 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  52.59 
 
 
422 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  50.48 
 
 
425 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  53.33 
 
 
417 aa  398  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  51.55 
 
 
422 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  51.57 
 
 
421 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  53.56 
 
 
416 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  51.55 
 
 
422 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  51.31 
 
 
422 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  50.12 
 
 
420 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  52.22 
 
 
405 aa  353  5e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  52.22 
 
 
437 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  43.87 
 
 
1270 aa  335  1e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  42.32 
 
 
410 aa  335  1e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  45.79 
 
 
443 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  43.26 
 
 
439 aa  331  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  43.41 
 
 
446 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  45.11 
 
 
445 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  47.79 
 
 
367 aa  325  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  42.75 
 
 
446 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  48.67 
 
 
575 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  41.98 
 
 
441 aa  315  8e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  45.52 
 
 
453 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  43.44 
 
 
438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  41.43 
 
 
471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  47.57 
 
 
437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  44.31 
 
 
430 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  41.43 
 
 
470 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  42 
 
 
438 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  46.68 
 
 
442 aa  300  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  43.69 
 
 
430 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  42.68 
 
 
444 aa  286  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  43.84 
 
 
653 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  45.68 
 
 
426 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  45.79 
 
 
426 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  39.07 
 
 
447 aa  275  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  40.84 
 
 
419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  41.98 
 
 
428 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  43.99 
 
 
437 aa  256  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  42.66 
 
 
379 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40.66 
 
 
388 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  43.14 
 
 
389 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  42.94 
 
 
389 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  43.47 
 
 
406 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  45.75 
 
 
396 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  41.4 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  47.26 
 
 
395 aa  243  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.51 
 
 
438 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  40.68 
 
 
387 aa  242  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  40.74 
 
 
419 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  39.95 
 
 
399 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  42.82 
 
 
389 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  44.97 
 
 
395 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  40.17 
 
 
389 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  39.3 
 
 
403 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  41.64 
 
 
387 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  40.86 
 
 
412 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  42.46 
 
 
389 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  38.05 
 
 
439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  38.52 
 
 
466 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  42.61 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  38.12 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  41.92 
 
 
390 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  46.29 
 
 
396 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  45.53 
 
 
399 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  45.53 
 
 
399 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  43.7 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  42.78 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  46.31 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  42.2 
 
 
393 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  44.66 
 
 
396 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  40.4 
 
 
387 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  37.87 
 
 
465 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  46.29 
 
 
396 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  41.69 
 
 
391 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  41.06 
 
 
387 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  46.29 
 
 
396 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  47.01 
 
 
395 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  38.05 
 
 
465 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  41.48 
 
 
390 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  41.83 
 
 
425 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  41.41 
 
 
398 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  39.7 
 
 
388 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  42.23 
 
 
393 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  38.05 
 
 
471 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  40.18 
 
 
387 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  40.18 
 
 
387 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  40.18 
 
 
387 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  38.56 
 
 
435 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  37.8 
 
 
471 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  42.94 
 
 
392 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  40.17 
 
 
399 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1004  hippurate hydrolase  38.94 
 
 
383 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  40.47 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>