More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3968 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  81.73 
 
 		 422 aa  706    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 424 aa  862    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  76.33 
 
 		 431 aa  627  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  74.21 
 
 		 420 aa  624  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  73.97 
 
 		 420 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  63.95 
 
 		 421 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  61.94 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  58.99 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  55.48 
 
 		 437 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  53.51 
 
 		 450 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  53.04 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  53.04 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  52.55 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  53.1 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  51.5 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  50.85 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  50.48 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  50 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  49.01 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  55.88 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  49.38 
 
 		 1270 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  51.2 
 
 		 575 aa  359  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  46.75 
 
 		 471 aa  358  8e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  46.72 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  46.75 
 
 		 470 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  51.87 
 
 		 405 aa  355  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  47.38 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  47.38 
 
 		 653 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  45.37 
 
 		 442 aa  322  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  41.15 
 
 		 446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  42.37 
 
 		 445 aa  309  8e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  47.21 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  40.95 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  42.12 
 
 		 446 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  43.14 
 
 		 438 aa  302  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  42.26 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  40.24 
 
 		 430 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  45.94 
 
 		 426 aa  296  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  41.4 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  39.76 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  45.48 
 
 		 437 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  39.66 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  42.34 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  42.61 
 
 		 428 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  43.14 
 
 		 419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  39.45 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  43.94 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  44.14 
 
 		 389 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  44.51 
 
 		 412 aa  249  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  44.23 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  43.65 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  43.37 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  43.6 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.78 
 
 		 438 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  43.65 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  42.9 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  43.53 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  43.37 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  42.54 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  44.66 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  37.21 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  40.96 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  42.54 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  42.54 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  42.74 
 
 		 393 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  43.32 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  42.27 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  42.27 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  38.94 
 
 		 459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  42.27 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  42.27 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.27 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  42.27 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  42.23 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  42.27 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  38.62 
 
 		 480 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  42.08 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  38.37 
 
 		 436 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  41.16 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  40.86 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  37.04 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  36.79 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  37.04 
 
 		 465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  41.71 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  36.79 
 
 		 466 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  39.88 
 
 		 390 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  40.76 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  39.77 
 
 		 458 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  41.85 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  41.01 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  41.21 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  38.65 
 
 		 389 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  41.26 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  44.34 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.39 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  38.44 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  43.6 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  35.16 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  36.98 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  40.78 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>