More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0023 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  100 
 
 		 417 aa  832    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  58.06 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  57 
 
 		 416 aa  428  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  54.07 
 
 		 420 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  54 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  53.83 
 
 		 422 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  53.5 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  53.83 
 
 		 422 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  53.57 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  51.5 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  50.86 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  47.78 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  53.02 
 
 		 420 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  52.26 
 
 		 421 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  49.5 
 
 		 1270 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  45.15 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  52.61 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  49.16 
 
 		 450 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  53.33 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  43.96 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  43.35 
 
 		 410 aa  332  6e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  45.94 
 
 		 367 aa  326  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  46.8 
 
 		 575 aa  325  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  43.03 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  42.39 
 
 		 443 aa  312  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  43.95 
 
 		 453 aa  312  7.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  40.24 
 
 		 441 aa  305  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  39.9 
 
 		 446 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  40.65 
 
 		 471 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  44.7 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  40.65 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  41.87 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  41.5 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  40.2 
 
 		 438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  44.11 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  42.89 
 
 		 428 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  41.52 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  41.77 
 
 		 430 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  44.86 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  41.79 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  38.39 
 
 		 447 aa  269  7e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  40.05 
 
 		 465 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  40.71 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  39.8 
 
 		 465 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  40.95 
 
 		 419 aa  263  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  39.8 
 
 		 466 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  43.75 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  40.54 
 
 		 653 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  39.95 
 
 		 435 aa  259  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  38.81 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  37.88 
 
 		 471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  41.8 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  43.47 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  38.56 
 
 		 465 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  43.75 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  38.56 
 
 		 470 aa  246  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  40.3 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  44.44 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  43.54 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  43.64 
 
 		 412 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  44.6 
 
 		 389 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  45.33 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  41.8 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  42.3 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  44.6 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  39.8 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  42.41 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  42.19 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  42.86 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  41.76 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  40.06 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  41.76 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  42.05 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  41.76 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  42.05 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  41.76 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  42.86 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  42.15 
 
 		 394 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  37.4 
 
 		 438 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  38.94 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  40.35 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  42.94 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  42.94 
 
 		 399 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  39.63 
 
 		 480 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  42.94 
 
 		 399 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  45.48 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  39.77 
 
 		 387 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  39.77 
 
 		 387 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  44.04 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  38.66 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  42.77 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  42.9 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  39.48 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  42.64 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  42.64 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  40.7 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  41.16 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  39.77 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  38.37 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  42.62 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>