More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2148 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  100 
 
 		 422 aa  856    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  81.73 
 
 		 424 aa  706    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  73.85 
 
 		 420 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  73.97 
 
 		 420 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  74.29 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  62.47 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  60.49 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  55.88 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  52.44 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  54.34 
 
 		 367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  51.33 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  51.09 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  51.09 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  50.86 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  51.09 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  52.27 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  47.43 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  47.51 
 
 		 1270 aa  378  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  51.21 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  47.12 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  52.59 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  51.44 
 
 		 575 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  50.87 
 
 		 405 aa  347  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  46 
 
 		 471 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  46 
 
 		 470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  44.92 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  47.37 
 
 		 653 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  45.17 
 
 		 442 aa  319  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  45.07 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  43.38 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  43.63 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  47.12 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  40.33 
 
 		 446 aa  299  8e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  42.86 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  41.73 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  40.58 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  42.93 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  40.64 
 
 		 438 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  45.36 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  43.15 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  39.66 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  38.41 
 
 		 447 aa  276  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  45.11 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  42.16 
 
 		 428 aa  269  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  42.64 
 
 		 419 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  38.88 
 
 		 419 aa  257  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  46.25 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  40.11 
 
 		 389 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.41 
 
 		 438 aa  237  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  40.14 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  41.53 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  42.27 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  39.83 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  42.27 
 
 		 394 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  40.52 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2549  amidohydrolase  41.44 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  40.34 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  41.44 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  36.25 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  39.11 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  39.57 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  39.57 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  39.57 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  39.57 
 
 		 396 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  39.57 
 
 		 396 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  39.57 
 
 		 396 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  39.57 
 
 		 396 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  38.44 
 
 		 459 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  37.41 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  41.44 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  40.06 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  37.16 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  37.41 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  40.88 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  40.88 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  40.88 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0143  amidohydrolase  38.74 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  38.73 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  35.63 
 
 		 432 aa  222  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  34.73 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  36.32 
 
 		 480 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  40.76 
 
 		 458 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  40.88 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  38.44 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  46.52 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  40.77 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  34.81 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  35.82 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  42.12 
 
 		 391 aa  216  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  36.24 
 
 		 379 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  39.39 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  36.95 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  35.32 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  40.11 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  47.84 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  39.78 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  40.62 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  36.7 
 
 		 471 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  39.26 
 
 		 387 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  36.7 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>