More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0288 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0288  amidohydrolase  100 
 
 		 575 aa  1162    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2437  peptidase M20D, amidohydrolase  57.75 
 
 		 653 aa  598  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  51.94 
 
 		 420 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  51.2 
 
 		 420 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  50.36 
 
 		 421 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3968  peptidase M20D, amidohydrolase  51.2 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  51.67 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2148  amidohydrolase  51.44 
 
 		 422 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5217  peptidase M20D, amidohydrolase  48.91 
 
 		 425 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  46.53 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1139  amidohydrolase  47.58 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0023  amidohydrolase  46.8 
 
 		 417 aa  354  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.69346  normal  0.453416 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  44.26 
 
 		 1270 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1337  peptidase M20D, amidohydrolase  48.21 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1355  amidohydrolase  48.21 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1373  amidohydrolase  48.21 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4743  amidohydrolase  50 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3715  amidohydrolase  50.59 
 
 		 437 aa  342  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342628  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1971  amidohydrolase  50 
 
 		 420 aa  341  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.281082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3669  amidohydrolase  48.57 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2056  peptidase M20D, amidohydrolase  45.05 
 
 		 443 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04320  amidohydrolase  48.88 
 
 		 405 aa  333  5e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0556  amidohydrolase  45.7 
 
 		 442 aa  332  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3443  peptidase M20D, amidohydrolase  48.48 
 
 		 367 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2568  amidohydrolase  48.51 
 
 		 426 aa  323  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3698  amidohydrolase  47.37 
 
 		 437 aa  317  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2416  amidohydrolase  46.73 
 
 		 426 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.451042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4199  amidohydrolase  46.73 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  41.58 
 
 		 471 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0543  amidohydrolase  48.67 
 
 		 427 aa  309  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  41.34 
 
 		 470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0452  amidohydrolase  41.01 
 
 		 410 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.598311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0940  peptidase M20D, amidohydrolase  42.89 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.397938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2688  amidohydrolase  43.48 
 
 		 445 aa  300  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.101321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2928  amidohydrolase  41.71 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  41.71 
 
 		 446 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1597  peptidase M20D, amidohydrolase  42.82 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0854  amidohydrolase family protein  40.24 
 
 		 438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2532  amidohydrolase  39.52 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167108  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1822  amidohydrolase  44.36 
 
 		 453 aa  284  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.678575  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  40.98 
 
 		 446 aa  282  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2787  amidohydrolase  42.2 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2730  amidohydrolase  40.83 
 
 		 419 aa  272  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.407872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2228  amidohydrolase  41.25 
 
 		 430 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0617571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1999  amidohydrolase  41.01 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38809e-26 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3434  amidohydrolase  41.63 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  44.98 
 
 		 389 aa  243  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  43.77 
 
 		 389 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  37.59 
 
 		 465 aa  239  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  37.59 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.82 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  38.14 
 
 		 435 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  41 
 
 		 403 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  43.87 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  36.36 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  37.25 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  37.25 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  41.79 
 
 		 394 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  42.36 
 
 		 394 aa  231  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  41.34 
 
 		 389 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  39.73 
 
 		 438 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  42.3 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  41.5 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  38.08 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  42.6 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  41.79 
 
 		 394 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  43.47 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  41.79 
 
 		 394 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  42.17 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  41.79 
 
 		 394 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  42.47 
 
 		 425 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  40.7 
 
 		 406 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  42.68 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  42.68 
 
 		 399 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  42.68 
 
 		 399 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  45.29 
 
 		 396 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  36.8 
 
 		 465 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  42.07 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  34.8 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  36.67 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  39.55 
 
 		 391 aa  224  4e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  42.68 
 
 		 396 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  42.68 
 
 		 396 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  41.82 
 
 		 387 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  40.92 
 
 		 394 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  40.5 
 
 		 393 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  36.65 
 
 		 471 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  42.3 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  45.59 
 
 		 389 aa  223  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  42.51 
 
 		 396 aa  223  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  41.21 
 
 		 387 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  41.21 
 
 		 387 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  40.11 
 
 		 390 aa  223  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5424  hippuricase  39.88 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  41.67 
 
 		 387 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  37.8 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  36.41 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  39.19 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  38.54 
 
 		 480 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  37.8 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>