More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1258 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 431 aa  887    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  60.05 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  59.25 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  61.52 
 
 		 465 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  57.55 
 
 		 437 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  59.5 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  57.74 
 
 		 449 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  59.91 
 
 		 435 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  55.06 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  57.18 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  59.25 
 
 		 465 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  58.77 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  58.77 
 
 		 471 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  53.85 
 
 		 438 aa  488  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  56.39 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  53.16 
 
 		 459 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  53.85 
 
 		 438 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  49.65 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  51.22 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  45.81 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  49.88 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  50 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  48.48 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  39.32 
 
 		 407 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  41.35 
 
 		 410 aa  302  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  40.05 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1361  amidohydrolase  39.81 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  40.66 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2374  amidohydrolase  41.65 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  36.45 
 
 		 411 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2778  amidohydrolase  41.4 
 
 		 471 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  43.15 
 
 		 393 aa  289  8e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  38.61 
 
 		 390 aa  289  8e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  36.6 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  40.1 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  38.79 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  36.83 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.83 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  37.16 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4861  amidohydrolase  38.39 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  39.11 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  38.68 
 
 		 399 aa  276  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.37 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  38.08 
 
 		 399 aa  272  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  38.23 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  37.87 
 
 		 389 aa  272  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  38.12 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  39.95 
 
 		 454 aa  270  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  37.25 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  38.08 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  38.39 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  37.05 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  36.18 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  37.62 
 
 		 399 aa  264  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  36.41 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  37.28 
 
 		 394 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  36.97 
 
 		 395 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  37.25 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  37.1 
 
 		 389 aa  260  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  37.75 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  36.72 
 
 		 395 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  37.56 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  35.86 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  37.13 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  36.97 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  37.28 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  37.23 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  36.76 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0853  peptidase M20D, amidohydrolase  38.75 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  33.96 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  36.96 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  34.38 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  35.97 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  36.82 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  34.68 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  33.74 
 
 		 403 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07529  zinc metallopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09600)  39.3 
 
 		 439 aa  253  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  33.74 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1962  peptidase M20D, amidohydrolase  39.26 
 
 		 396 aa  253  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.904473 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.35 
 
 		 380 aa  252  9.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  34.76 
 
 		 415 aa  252  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  34.6 
 
 		 405 aa  252  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2524  amidohydrolase  37.41 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  0.871942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  36.25 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  36.25 
 
 		 430 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3364  amidohydrolase  37.41 
 
 		 420 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  38.52 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  35.37 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  37.84 
 
 		 394 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  35.82 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  36.86 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  36.75 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  36.86 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4612  amidohydrolase  38.98 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194835  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  37.84 
 
 		 394 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  36.6 
 
 		 395 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  36.76 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3172  peptidase M20D, amidohydrolase  36.66 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  36.44 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  35.93 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>